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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004287`

染色体: Chr01 坐标: 61083174-61085986 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004287`
名称	SmilChr01G004287
描述	transcription termination factor MTEF18, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61083174 - 61085986 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001065`
GeneID	`131001065`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001065`
原始查询	`SmilChr01G004287`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription termination factor MTEF18, mitochondrial-like
产物	transcription termination factor MTEF18%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G06810` (AT5G06810) transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830572] identity=37.5; qcov=1.01; evalue=5.34e-136; confidence=medium
Rice	`Os08g0518200` (P0700D12.120) - identity=39.5; qcov=0.883; evalue=1.04e-133; confidence=medium
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001065

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057783234.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057783234.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783234.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783234.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783234.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61083435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr1:61083773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr1:61083804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:61083919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:61084068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:61084174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:61084176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:61084177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr1:61084220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr1:61084293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr1:61085005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,B84,C54
`Chr1:61085018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,B84,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783234.1

590 aa

295

590

mTERF

PF02536 mTERF 175-247 aa PF02536 mTERF 181-404 aa PF02536 mTERF 284-447 aa PF02536 mTERF 431-565 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783234.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	175	247	2e-40	139.4	mTERF
`XP_057783234.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	181	404	2e-40	139.4	mTERF
`XP_057783234.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	284	447	2e-40	139.4	mTERF
`XP_057783234.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	431	565	2e-40	139.4	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927251.1
TTACTAAACCCTCAACGACAGCTCCTTTTCAACCTAACATAGGGATGCTGCAGTGGCACCACATGTTCTCAAAGGTACAACGCTCAAACCCCCATGTCCGAACGCCTTCAAGAAACCCCATCAAGATTACAGATTATCAGAGCGCCCCATTTGCTCAAATGGGTTTCTTTACTATGCGCACATAGCAATTTTACATCATCAAAATTCAGTCTTTATGTTAGTGGGTCGCATAATCTTGCACAAAAAGTTAGGTCGTATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001065
ATGTCCGAACGCCTTCAAGAAACCCCATCAAGATTACAGATTATCAGAGCGCCCCATTTGCTCAAATGGGTTTCTTTACTATGCGCACATAGCAATTTTACATCATCAAAATTCAGTCTTTATGTTAGTGGGTCGCATAATCTTGCACAAAAAGTTAGGTCGTATGGAACAGAGAGCTCTATTGATTTGAAAAATGGTGTGGATTTTGGTGGGAGTGGGAAAAAAGGGCGTGCAGTGAGAGCAGAAGCACAATCTGCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783234.1
MSERLQETPSRLQIIRAPHLLKWVSLLCAHSNFTSSKFSLYVSGSHNLAQKVRSYGTESSIDLKNGVDFGGSGKKGRAVRAEAQSALVEYFHLTRSFRIMDAENMSKNAPEFFNRLMKRVVIDDDSKIKHSVTRFLRYHPVNEFEPFFESIGLRHSEYAQYLPRNLMFLADDELLLENYYVLCNYGIERNRIGKIFKEANEVFRYDYGSLQPKLRYFENLGLRQSIVAKIVAASPNLLRGNVGEFVEFLEMLKKVEIEYE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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