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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004291`

染色体: Chr01 坐标: 61129063-61132865 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004291`
名称	SmilChr01G004291
描述	squamosa promoter-binding-like protein 17
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61129063 - 61132865 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001083`
GeneID	`131001083`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001083`
原始查询	`SmilChr01G004291`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	squamosa promoter-binding-like protein 17
产物	squamosa promoter-binding-like protein 17
Arabidopsis	`AT3G57920` (SPL15) squamosa promoter binding protein-like 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824961] identity=36.3; qcov=1.04; evalue=7.84e-51; confidence=medium
Rice	`Os08g0509600` (WFP) - identity=40.7; qcov=0.9; evalue=1.05e-53; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF03110 (SBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001083

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783272.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783272.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783272.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783272.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783272.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61129834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr1:61129928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr1:61131938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:61132148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B25,C11,C26,C69,D7
`Chr1:61132328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:61132545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,D11
`Chr1:61132561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,D11
`Chr1:61132604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:61132610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783272.1

360 aa

180

360

SBP

PF03110 SBP 70-143 aa

XP_057783280.1

360 aa

180

360

SBP

PF03110 SBP 70-143 aa

XP_057783289.1

360 aa

180

360

SBP

PF03110 SBP 70-143 aa

XP_057783298.1

360 aa

180

360

SBP

PF03110 SBP 70-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783272.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	70	143	3.5e-33	114.5	SBP domain
`XP_057783280.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	70	143	3.5e-33	114.5	SBP domain
`XP_057783289.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	70	143	3.5e-33	114.5	SBP domain
`XP_057783298.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	70	143	3.5e-33	114.5	SBP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927306.1
GAAAAAAAAAAGTGATGTGTTGTAAAGCTGCAGAGAGCTCCATAAAACTCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTCTTTGCGCTCCATTATTTTGACAGAAGTCTCTTCATAACACTGCTCCAGAAATCCATAGGATAGACCTCAAGCTGGCGTGATGGCCCATTAAAAGAGCAGCAATGAATGGGTTCTAGACAGCAAGAATGGATAAGGGCTCATCTTCCTCCTCCTCCTCTTCTTCCTCAGCTGGGCCGGACTCGCT...

XM_057927297.1
AAAAAAAAAAGTGATGTGTTGTAAAGCTGCAGAGAGCTCCATAAAACTCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTCTTTGCGCTCCATTATTTTGACAGAAGTCTCTTCATAACACTGCTCCAGAAATCCATAGGATAGACCTCAAGCTGGCGTGATGGCCCATTGTCAGGTTCTCCACTCTCTCACACACACATACACACACACACAAACACAGAGTCCACGTCGTTAATTTTGTTTTTACAGCAAATTTAATAGAAAGC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131001083
ATGGATAAGGGCTCATCTTCCTCCTCCTCCTCTTCTTCCTCAGCTGGGCCGGACTCGCTCAATGGGTTGAAGTTTGGCAAGAAAATCTACTTTGAGGGTGTGGGTTCTGGCCTGCAGCAGCCCAAGACCGGCGCCGCGCCGCCTCTGCCGCCGTCTCCGGCCAAGAAGGGGAGGACTGCGGCTGTGCAGGGCGCCCAGCCGCCTAGGTGTCAGGTGGAGGGGTGCAGAGTAGATCTGAGTGATGTTAAGGCTTACTATTC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057783272.1
MDKGSSSSSSSSSSAGPDSLNGLKFGKKIYFEGVGSGLQQPKTGAAPPLPPSPAKKGRTAAVQGAQPPRCQVEGCRVDLSDVKAYYSRHKVCGMHSKSPNVIVAGLEQRFCQQCSRFHQLSEFDQGKRSCRRRLAGHNERRRKPPAGSLLSPRYGSLSPSIFDRSKSGGFVMDFSTYPALNGRDLWPDTSSERVMGNQASITGKYQLPLHSSSQNPLSDLLQGTTPRPSYSGPGASSHGCFDGVPDSTNALSLLSTQSWG...

XP_057783280.1
MDKGSSSSSSSSSSAGPDSLNGLKFGKKIYFEGVGSGLQQPKTGAAPPLPPSPAKKGRTAAVQGAQPPRCQVEGCRVDLSDVKAYYSRHKVCGMHSKSPNVIVAGLEQRFCQQCSRFHQLSEFDQGKRSCRRRLAGHNERRRKPPAGSLLSPRYGSLSPSIFDRSKSGGFVMDFSTYPALNGRDLWPDTSSERVMGNQASITGKYQLPLHSSSQNPLSDLLQGTTPRPSYSGPGASSHGCFDGVPDSTNALSLLSTQSWG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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