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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004303`

染色体: Chr01 坐标: 61211681-61212465 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004303`
名称	SmilChr01G004303
描述	uncharacterized SmilChr01G004303
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61211681 - 61212465 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011143`
GeneID	`131011143`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011143`
原始查询	`SmilChr01G004303`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=26.5; qcov=0.784; evalue=1.05e-13; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.7; qcov=0.874; evalue=1.12e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011143

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057794911.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057794911.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057794911.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794911.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794911.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61211707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A19,B105,B53,B77,C39
`Chr1:61211707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B105,B53,B77,C39
`Chr1:61211803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B35
`Chr1:61211803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:61211819`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A1,B108,B40,B41,B60,B87,B94,C15,C5
`Chr1:61211829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:61211836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,D11
`Chr1:61211850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A24
`Chr1:61211850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr1:61211887`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	A1,A24,B108,B109,B131,B15,B29,B31,B32,B36,B4,B40,B41,B46,B47,B60,B72,B8,B81,B87,B94,C15,C3,C5,C59,C63,C75,D11,D2,D4
`Chr1:61211933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr1:61211945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794911.1

231 aa

116

231

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 34-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794911.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	34	128	7.7e-19	68.9	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938928.1
ATGAGGCCTTTGTCTGCGAGCAAGGGGAGTGGACAGAGGGTTCATGGGTTTGGAAGTAAGAAGGATGCTTGGAGATGGAAGGCCACAAAGGGCGGTGATTTCTCTACAAAATCTGCATACGATATTGTCAAAGCCGCAAAGACACGAAACATCAACTCCAATCCCACATCAGAGATCCTCAAGGAAGTGTGGAATACTCCGGCAACTCATAAGGCAAAAGTCACGACATGGAGGCTTGTTAGGAATAGGTTGCCAACCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011143
ATGAGGCCTTTGTCTGCGAGCAAGGGGAGTGGACAGAGGGTTCATGGGTTTGGAAGTAAGAAGGATGCTTGGAGATGGAAGGCCACAAAGGGCGGTGATTTCTCTACAAAATCTGCATACGATATTGTCAAAGCCGCAAAGACACGAAACATCAACTCCAATCCCACATCAGAGATCCTCAAGGAAGTGTGGAATACTCCGGCAACTCATAAGGCAAAAGTCACGACATGGAGGCTTGTTAGGAATAGGTTGCCAACCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794911.1
MRPLSASKGSGQRVHGFGSKKDAWRWKATKGGDFSTKSAYDIVKAAKTRNINSNPTSEILKEVWNTPATHKAKVTTWRLVRNRLPTCDNLRRRNIQIGVEESWCNACCHRSETCKHLFIECPKADAVWSGIQQWLGINGPRPNDITEHLEAFTNLGKKKHRKTLRALWMCITWLMWKNRNESRFDGKTWDVQALIREIKVMFWCWIKIFKLSNADVSFSSWMSQIFDLHAL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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