当前解析结果
SmilChr01G004315| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004315 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004315 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004315 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 61326946 - 61330648 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131001378 |
|---|---|
| GeneID | 131001378 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001378 |
| 原始查询 | SmilChr01G004315 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | caveolin-1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843981]; symbol=AT1G76480; hit=AT1G76480; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | caveolin-1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843981]; symbol=AT1G76480; hit=AT1G76480; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G76480 (AT1G76480)caveolin-1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843981] identity=53.5; qcov=0.846; evalue=4.13e-56; confidence=high |
| Rice | Os03g0804100- identity=54.5; qcov=0.766; evalue=2.3e-47; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001378 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.80000 | XP_057783733.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057783733.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.60000 | XP_057783733.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057783733.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783733.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:61327191 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr1:61327849 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr1:61328193 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A6,B104,B13,B27,C47 |
Chr1:61328260 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B108,C23 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。