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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004316`

染色体: Chr01 坐标: 61331580-61348844 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004316`
名称	SmilChr01G004316
描述	uncharacterized SmilChr01G004316
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61331580 - 61348844 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001353`
GeneID	`131001353`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001353`
原始查询	`SmilChr01G004316`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008360 (regulation of cell shape); GO:0008764 (UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase activity); GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0051301 (cell division)
KEGG	-
Pfam	PF02875 (Mur_ligase_C); PF08245 (Mur_ligase_M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001353

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783708.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057783708.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783708.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783708.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783708.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61339258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B16
`Chr1:61339266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C33
`Chr1:61339267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:61339674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,B9,C44
`Chr1:61339695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,B9,C44
`Chr1:61339957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr1:61340755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C14
`Chr1:61341204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783708.1

349 aa

174

349

Mur_ligase_M

Mur_ligase_C

PF08245 Mur_ligase_M 32-168 aa PF02875 Mur_ligase_C 194-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783708.1`	Pfam	`PF08245`	Mur_ligase_M	Domain	32	168	7.8e-15	56.1	Mur ligase middle domain
`XP_057783708.1`	Pfam	`PF02875`	Mur_ligase_C	Domain	194	316	7.5e-10	40.4	Mur ligase, glutamate ligase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927725.1
TAAATGCTAAAGATGGTCATTTGAAGACGATTCTTGGTTGTTTTGATCATGAACTATTTGTCAAGGCAGATCTGATAGTTGTTTCCCCAGGAGTTCCTCTGGAAAATTATTGTCTAGCATGTTTGTTGCAATCTGGGAAGCGTGTCATATCTGAGTTAGATTTTGCTGCTGAAGTACTTCCACGGTGCACAAAGGTTTAGGCTATCACTGGAACTAATGGAAAATCTAATGTGGCCACTTTCGCTGGACAGATGCTCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001353
ATGCTCAGCCATTTGAACATTAGAACTTTTGTTGGTGGAAACCTCAGTATTCCTCTCTCAGAAGCAGCTTTCGAGTGCTTGTCATCACCTCAAAAACCTTTCCAGGCTGCTGTAGTGGAAGTAAGCAGCTATCAGCTAGAAATTCCGAACAAGTTCTTCTGCCCTTCGGTTTCTGTTATCTTAAATCTCACTCCTGATCACCTAGAGAGACACAAGTCCATGAGGAATTATTCCACGATCAAGTGCCGTGTCTTTTCCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783708.1
MLSHLNIRTFVGGNLSIPLSEAAFECLSSPQKPFQAAVVEVSSYQLEIPNKFFCPSVSVILNLTPDHLERHKSMRNYSTIKCRVFSRMSGRKMAILPMGNPYITDAIACHANECMFAWIGGYPGIEVDMEQKVANFNVPGMELLSQLPLDALQAVGTHNYYNAAIAALSVIGLDVEIDIAAISSTIDKLKAPPHRVQIVHEDRHGVTWVDDSKATNVEATYAGLMGLTEKKLVVLLGGLSKILDAQGSNGFEQLIELLKY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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