当前解析结果
SmilChr01G004343| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004343 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004343 |
| 描述 | probable glycosyltransferase STELLO2 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 61598473 - 61602049 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001567 |
|---|---|
| GeneID | 131001567 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001567 |
| 原始查询 | SmilChr01G004343 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable glycosyltransferase STELLO2 |
| 产物 | probable glycosyltransferase STELLO2 |
| Arabidopsis | AT2G41770 (AT2G41770)transmembrane protein, putative (DUF288) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818776] identity=72; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os07g0656400- identity=58.1; qcov=0.929; evalue=0; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03385 (STELLO) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001567 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 1.00000 | XP_057784024.1 |
| 2 | Golgi stack | 高尔基堆 | 0.20000 | XP_057784024.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057784024.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057784024.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057784024.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:61599005 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B16,B78,C5,D7 |
Chr1:61599035 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,B24 |
Chr1:61599826 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B27,C47 |
Chr1:61599878 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B103,B40,C15,C62 |
Chr1:61599879 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B46 |
Chr1:61600028 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B24,B66,C37 |
Chr1:61600090 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,B24 |
Chr1:61600189 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B66,B94,B97,C59 |
Chr1:61600216 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B1,C37,C63,D9 |
Chr1:61600281 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B32 |
Chr1:61600287 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B78,C5 |
Chr1:61600627 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C80,C84 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057784024.1PF03385
STELLO 354-466 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057784024.1 |
Pfam | PF03385 |
STELLO | Family | 354 | 466 | 4.6e-11 | 42.9 | STELLO glycosyltransferases |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。