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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004360`

染色体: Chr01 坐标: 61789442-61790721 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004360`
名称	SmilChr01G004360
描述	protein MIZU-KUSSEI 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61789442 - 61790721 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002158`
GeneID	`131002158`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002158`
原始查询	`SmilChr01G004360`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MIZU-KUSSEI 1
产物	protein MIZU-KUSSEI 1
Arabidopsis	`AT2G41660` (MIZ1) MIZU-KUSSEI-like protein (Protein of unknown function, DUF617) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818764] identity=58.5; qcov=0.861; evalue=3.1e-78; confidence=high
Rice	`Os02g0709600` (OJ1311_H06.6-2) - identity=60.4; qcov=0.684; evalue=5.03e-65; confidence=high
GO	GO:0010274 (hydrotropism)
KEGG	-
Pfam	PF04759 (DUF617)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002158

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057784710.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057784710.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784710.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784710.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784710.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61789676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:61789728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C52
`Chr1:61789855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,B99
`Chr1:61789879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr1:61789986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B104,B12
`Chr1:61790025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:61790133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B38,B39
`Chr1:61790145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B21
`Chr1:61790156`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B139
`Chr1:61790156`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B139
`Chr1:61790157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:61790259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784710.1

266 aa

133

266

DUF617

PF04759 DUF617 98-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784710.1`	Pfam	`PF04759`	DUF617	Family	98	265	5.2e-69	232.1	Protein of unknown function, DUF617

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928727.1
TGGAAATGTGATTATTTAAATATAGAAATGAAAGGCAATTGGATATAAATATGAAATATATGCACAAGGCATGACTCACTCCATTCATCACTAACCTCCACAGTTCCCCTTTATATTCCACCCAGCTCCCTAAAACCATCATCATTCCTTGTCCCCTCCATTCACTATTTTTTTTTCTTCCCTCTCAATTATAAACCCCCATTTTCAACATTAATTCCTCAAATTTAAGCCCCTCACCTCATTGGGATTTTCATTTTTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002158
ATGATGAGACAGCATGAGCAAATAGTGGCAAGCCTTCCAAGAAACAGCAGCTGCAAGAGCAGCAGCAAGATCATCCCCGCCAGCTTCACTCGCTCCACCTCCAACGCCGACGCCTTCCACCACAAAGCCCTCGTCCGCCGCCCCGCCGCCGCCCTCCACCAAACACGCAGCGGCGTCTCCACCTTCCTCCGCTCCCTCATCTCCATCTTCACCTTCCCCTCCTTCCTCCCGGCGTGCCGCTGGCTCCACATCCCCACCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784710.1
MMRQHEQIVASLPRNSSCKSSSKIIPASFTRSTSNADAFHHKALVRRPAAALHQTRSGVSTFLRSLISIFTFPSFLPACRWLHIPTHLSVTPSLGRKVTGTLFGHRRGHVSFAVQDDPRSEPVLLIELALSTSTLVKEMSSGLVRIALECEKPPPAPRGGRAAASRLFAEPAWTMYCNGRKCGYAAARAWTESDRHVLRTVQSVSVGAGVIPVVDDGRKGSAAEGELLYMRARFERVVGSRDSEAFYMLNPDGNGGPELS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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