当前解析结果
SmilChr01G004364| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004364 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004364 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004364 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 61834267 - 61838838 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131002369 |
|---|---|
| GeneID | 131002369 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131002369 |
| 原始查询 | SmilChr01G004364 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131002369 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057784852.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057784852.1 |
| 3 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057784852.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057784852.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057784852.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:61834474 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 10 | A18,B122,B138,B17,B22,B32,B44,B64,C71,C72 |
Chr1:61834541 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B101,B71,C61,C68,C80 |
Chr1:61834550 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B119,B43,B49,C1,C45 |
Chr1:61834604 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B136 |
Chr1:61834608 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 67 | A15,A3,A4,A5,A9,B1,B101,B106,B11,B115,B118,B120,B124,B127,B129,B133,B138,B139,B14,B3,B30,B35,B40,B41,B47,B48,B5,B58,B6,B66,B67,B7,B71,B74,B86,B89,B9,B94,C14,C15,C17,C21,C28,C29,C36,C39,C43,C44,C46,C49,C50,C51,C54,C58,C60,C61,C65,C66,C67,C68,C71,C72,C75,C77,C80,C87,D7 |
Chr1:61834614 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C32,C68 |
Chr1:61834640 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 29 | A13,A15,A24,A4,B101,B112,B117,B20,B21,B26,B27,B33,B50,B55,B67,B69,B73,B75,B81,B9,C28,C42,C51,C54,C55,C58,C61,C80,D5 |
Chr1:61834647 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A13,B139,C28,C73 |
Chr1:61836118 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C37 |
Chr1:61836118 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C37 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。