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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004382`

染色体: Chr01 坐标: 62003325-62006255 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004382`
名称	SmilChr01G004382
描述	S-formylglutathione hydrolase
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62003325 - 62006255 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002052`
GeneID	`131002052`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002052`
原始查询	`SmilChr01G004382`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	S-formylglutathione hydrolase
产物	S-formylglutathione hydrolase
Arabidopsis	`AT2G41530` (SFGH) S-formylglutathione hydrolase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818751] identity=79.2; qcov=0.976; evalue=1.84e-176; confidence=high
Rice	`Os01g0939700` (B1150F11.18-1) - identity=71.7; qcov=0.965; evalue=1.65e-151; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0018738 (S-formylglutathione hydrolase activity); GO:0046294 (formaldehyde catabolic process)
KEGG	smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00326 (Peptidase_S9); PF00756 (Esterase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002052

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784703.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057784703.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057784703.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784703.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784703.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62004971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr1:62005406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B128,B44,B57,B77
`Chr1:62005877`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B28
`Chr1:62005877`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B28
`Chr1:62005880`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B28
`Chr1:62005880`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784703.1

286 aa

143

286

Esterase

Peptidase_S9

PF00756 Esterase 27-278 aa PF00326 Peptidase_S9 111-267 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784703.1`	Pfam	`PF00756`	Esterase	Domain	27	278	1.2e-63	215.9	Putative esterase
`XP_057784703.1`	Pfam	`PF00326`	Peptidase_S9	Domain	111	267	1.8e-11	44.7	Prolyl oligopeptidase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928720.1
TAATCGAGGCCCAAAGGTCTTTGTATTTCACTCACCACTCCACTGCTGTGGCTAGAAATATCTCTCCAGTCATTCATGACCAGTGTGAAAAAGCTAGGATCAGACTGAGAGGAGAGGAGCTTCTTTACTGTGTGTTGTGTGTGAAAGAAAATGGAGTCCGATGGAAAACCTACAGAACTCAGCAGCGTGAAGATGTTTGATGGATACAACAAGAGATACAAACACTACAGCCCTACGCTCGGCTGCTCTATGACCTTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002052
ATGGAGTCCGATGGAAAACCTACAGAACTCAGCAGCGTGAAGATGTTTGATGGATACAACAAGAGATACAAACACTACAGCCCTACGCTCGGCTGCTCTATGACCTTCCACATATACTTCCCTCCTTCATCTTCTCCTTCCCAAAAATTCCCTGTACTTTACTGGCTGTCTGGGCTTACATGCAATGATGAGAATTTTATAGCTAAATCCGGTGCACAACGTGTTGCTTCTGCTGAGGGTGTTGCTCTGATAGCCCCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784703.1
MESDGKPTELSSVKMFDGYNKRYKHYSPTLGCSMTFHIYFPPSSSPSQKFPVLYWLSGLTCNDENFIAKSGAQRVASAEGVALIAPDTSPRGLNIQGEADSWDFGVGAGFYLNATQEKWKNWQMYDYIVKELPTLLQENFPQLDTSRASISGHSMGGHGALIIYLKNLDKYKSVSAFAPVVNPINCPWGQKAFTNYLGENKAAWEEYDASILVSKYTDVSATILIDQGDADKFLSEQLLPQKFDEACRKAKVPLLLRMQP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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