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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004383`

染色体: Chr01 坐标: 62010628-62013104 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004383`
名称	SmilChr01G004383
描述	calcium-binding protein CBP-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62010628 - 62013104 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002084`
GeneID	`131002084`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002084`
原始查询	`SmilChr01G004383`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calcium-binding protein CBP-like
产物	calcium-binding protein CBP-like
Arabidopsis	`AT3G10300` (AT3G10300) Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820192] identity=63.5; qcov=1.13; evalue=3.24e-121; confidence=high
Rice	`Os11g0140600` - identity=71.6; qcov=0.996; evalue=6.3e-124; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF13202 (EF-hand_5); PF13405 (EF-hand_6); PF13499 (EF-hand_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002084

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784705.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057784705.1`
3	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057784705.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057784705.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057784705.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62010883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr1:62011010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:62011018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr1:62011055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784705.1

272 aa

136

272

EF-hand_5

EF-hand_6

EF-hand_7

EF-hand_5

PF13202 EF-hand_5 108-128 aa PF13405 EF-hand_6 108-133 aa PF13405 EF-hand_6 172-200 aa PF13499 EF-hand_7 172-232 aa PF13202 EF-hand_5 174-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784705.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	108	128	1.3e-13	50.4	EF hand
`XP_057784705.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	108	133	3.5e-15	54.9	EF-hand domain
`XP_057784705.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	172	200	3.5e-15	54.9	EF-hand domain
`XP_057784705.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	172	232	7.2e-17	62.2	EF-hand domain pair
`XP_057784705.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	174	194	1.3e-13	50.4	EF hand

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928722.1
AAAAAATGTTATAAATACATCACTTCAACTTTCACCTAAACACTTCGATCAATTAATTGCAGCTTATCCATTTTCCCAACATGTCTAATTACCCGCACCACAATCCCTCCGGCGCCGGCTACCCCTACGGCGCTCAGCCGCCCTCGTCGCAGTCCTACCCATCTGGTCCCTACGGCGCTCAGCCACCTCCCGGCCAATCCTCACCCTACGCCCCCGCCCCCTCCCCCTACGGCGCCCCCTCAGCTCCCCCTGGCGCGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002084
ATGTCTAATTACCCGCACCACAATCCCTCCGGCGCCGGCTACCCCTACGGCGCTCAGCCGCCCTCGTCGCAGTCCTACCCATCTGGTCCCTACGGCGCTCAGCCACCTCCCGGCCAATCCTCACCCTACGCCCCCGCCCCCTCCCCCTACGGCGCCCCCTCAGCTCCCCCTGGCGCGCCCAACCAGTCCTACGGCGCCCCCTCGGCTCCCCCCGGCGCGCCCAACCAGTCCTACGGCGGCTACCCGCCTTCGGCGTACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784705.1
MSNYPHHNPSGAGYPYGAQPPSSQSYPSGPYGAQPPPGQSSPYAPAPSPYGAPSAPPGAPNQSYGAPSAPPGAPNQSYGGYPPSAYGSPFAALTPSAFPPGTDPSVISCFQMADQDGSGFIDDKELQRALSSYNQSFSLRTVHLLMYLFTNTNTRKIGPKEFTQVFYSLQSWRAIFERFDRDRSGKIDMNELRESLLSLGFSVSPVILELLVSKFDKSGGKNKAIEYDNFIECCLTVKGLTEKFKEKDTSFSGSATFTYE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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