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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004386`

染色体: Chr01 坐标: 62023851-62031540 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004386`
名称	SmilChr01G004386
描述	uncharacterized SmilChr01G004386
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62023851 - 62031540 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001509`
GeneID	`131001509`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001509`
原始查询	`SmilChr01G004386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 3E [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824896]; symbol=EIF3E; hit=AT3G57290; species=arabidopsis; confidence=low
产物	eukaryotic translation initiation factor 3E [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824896]; symbol=EIF3E; hit=AT3G57290; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G57290` (EIF3E) eukaryotic translation initiation factor 3E [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824896] identity=83; qcov=0.342; evalue=0; confidence=low
Rice	`Os07g0222300` (EIF3E) - identity=74.9; qcov=0.344; evalue=0; confidence=low
GO	GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005852 (eukaryotic translation initiation factor 3 complex); GO:0006413 (translational initiation)
KEGG	-
Pfam	PF09440 (eIF3_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001509

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783888.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057783888.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057783888.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057783888.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783888.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62026186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C70
`Chr1:62026215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C41
`Chr1:62026356`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B35
`Chr1:62026356`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B35
`Chr1:62026429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B37,B82,C10
`Chr1:62026530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B133,C14
`Chr1:62026580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr1:62026695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr1:62026702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:62026703`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B37
`Chr1:62026703`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B37
`Chr1:62026723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B4,B47,C17,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783888.1

998 aa

499

998

eIF3_N

PF09440 eIF3_N 6-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783888.1`	Pfam	`PF09440`	eIF3_N	Domain	6	138	4.3e-50	170.2	eIF3 subunit 6 N terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927905.1
ATTTAAAAAGACCCCGTTCAAAAAAAAAAAAAAAAGGAATTATTAAAAACCCTAGTTCCCAAACCCAAATCAGATAAATTTTTTCGTTCCAGAATCAATCCAGGCCTTCCAGCGCCGCCGCAAAACCACCGCTTCAGTCAGTTAACGGAGACAATGGCGTCGCAATACGACCTGACGCCGCGGATAGCGCCGCATCTAGACAGGCATCTGGTGTTCCCGCTACTCGAGTTCCTACAGGAGAGAGGGTTGTACCCTGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001509
ATGGCGTCGCAATACGACCTGACGCCGCGGATAGCGCCGCATCTAGACAGGCATCTGGTGTTCCCGCTACTCGAGTTCCTACAGGAGAGAGGGTTGTACCCTGAGGAAGATATTTTGAAGGCGAAGATTGAGCTGCTCAACCACACTAACATGGTTGATTACGCCATGGATATTCATAAATCTCTCTACCGATCGGACGATGTTCCTCAAGACATGATCGATAGGAGAGCTGAGGTGGTGGGTAGGCTGAAGGCGTTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783888.1
MASQYDLTPRIAPHLDRHLVFPLLEFLQERGLYPEEDILKAKIELLNHTNMVDYAMDIHKSLYRSDDVPQDMIDRRAEVVGRLKALEDGAAPLIAFLQNPHAVQELRADKQYNLQMLNERYQIGAEQIDALYDYAKFQFECGNYSGAADYLYQYRALCTNSDKSLSALWGKLAAEVLMQNWDIALKELNRLKEIIDSKNFSSPLNQVQLMHWSLFIFFNHDNGRTQIIDLFNQDKYLNAIQTNAPHLLRYLATAFIVNKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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