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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004410`

染色体: Chr01 坐标: 62202766-62206499 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004410`
名称	SmilChr01G004410
描述	calmodulin binding protein PICBP-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62202766 - 62206499 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001539`
GeneID	`131001539`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001539`
原始查询	`SmilChr01G004410`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calmodulin binding protein PICBP-like
产物	calmodulin binding protein PICBP-like
Arabidopsis	`AT5G04020` (AT5G04020) calmodulin binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830281] identity=33.1; qcov=0.556; evalue=3.09e-52; confidence=low
Rice	`Os05g0381700` - identity=52.9; qcov=0.095; evalue=8.32e-23; confidence=weak
GO	GO:0005516 (calmodulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF07839 (CaM_binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001539

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057783943.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783943.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783943.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783943.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783943.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62203172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:62203199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr1:62203265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:62203269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr1:62203590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B133,C14
`Chr1:62203670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr1:62203685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B20
`Chr1:62203691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B86,B9,C18,C44
`Chr1:62203711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr1:62203730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C47
`Chr1:62203739`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B54
`Chr1:62203739`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783943.1

914 aa

457

914

CaM_binding

PF07839 CaM_binding 534-634 aa PF07839 CaM_binding 818-910 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783943.1`	Pfam	`PF07839`	CaM_binding	Domain	534	634	2e-52	177.6	Plant calmodulin-binding domain
`XP_057783943.1`	Pfam	`PF07839`	CaM_binding	Domain	818	910	2e-52	177.6	Plant calmodulin-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927960.1
GTGACATACTTATACCAAGTGAGAATCGGTTGAATAAAAAAGTAGAATTTTGTTTTAAAACAAGATCCAAAATTTGAAACCTATTATATTTTCAGTCATCATCTGATGCCATTTCTTGTTGGAAACAACTTCTATGCAACAAATCTTTTTTCCCCAAAGCAAAAAAGATTATAGCCAGCTCATATTCACACCTCAAAACTCGCTCTGGATTTCTGCAAAAACTGAGTCTTGATTTTTGCTACTGTGAAGATTTGAGTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001539
ATGGATTCCGTTGATTCATCGCCAAATTATATGAAGGCCAGAAGCAGATTTGATCCAAAGAAAGAAAATTCTCCGGGAGGAAGTGAATCTGATGAGATTATGTGCGTTAGTTGTGGATCAGCAGTTATGGAAGTTTCCAATAATGGAATCAAGCATAACTTTGCAACTGTTAGGAGGAGACCAAAACCAAGAGTCATCCAATTATCCGATAATGATGAGGCGTCGCCTCATTATCTCAAGGCCACTACTTCTTCTGAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783943.1
MDSVDSSPNYMKARSRFDPKKENSPGGSESDEIMCVSCGSAVMEVSNNGIKHNFATVRRRPKPRVIQLSDNDEASPHYLKATTSSEGKKSRSSESRLHDSSHPKLALSRKSSFRNVRILMKRTSFNFKPKRSLLRDAGVERATYSSTLKDSKFPAPLEIQLHPSREEESDDTSAVKVCRYHHCSLHGGCHAGAETAPPLKHFLYKRRQSLRKQKSMVPKADRKKNLHKRVIPHEVESLNQERFSDSIAVSGVLNEETELF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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