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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004414`

染色体: Chr01 坐标: 62267610-62269918 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004414`
名称	SmilChr01G004414
描述	L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62267610 - 62269918 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001958`
GeneID	`131001958`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001958`
原始查询	`SmilChr01G004414`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mitochondrial
产物	L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G56840` (AT3G56840) FAD-dependent oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824851] identity=63.8; qcov=0.937; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0809900` - identity=62.4; qcov=0.953; evalue=7.13e-168; confidence=high
GO	GO:0003973 ((S)-2-hydroxy-acid oxidase activity); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0047545 ((S)-2-hydroxyglutarate dehydrogenase activity)
KEGG	smil00650 (Butanoate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01266 (DAO); PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001958

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057784598.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057784598.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784598.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784598.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784598.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62268164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C10
`Chr1:62268201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B24
`Chr1:62268348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C32,C68
`Chr1:62268366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:62268459`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	40	A15,A22,A23,A24,A3,B102,B11,B117,B129,B18,B21,B23,B28,B31,B39,B5,B51,B54,B55,B6,B63,B7,B71,B87,C18,C24,C34,C40,C43,C49,C55,C57,C72,C73,C74,C83,C87,D10,D11,D3
`Chr1:62268967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:62269446`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B36,C3
`Chr1:62269446`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B36,C3
`Chr1:62269447`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B36,C3
`Chr1:62269447`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B36,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784598.1

427 aa

214

427

DAO

NAD_binding_8

PF01266 DAO 37-418 aa PF13450 NAD_binding_8 39-78 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784598.1`	Pfam	`PF01266`	DAO	Domain	37	418	8.9e-58	197.2	FAD dependent oxidoreductase
`XP_057784598.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	39	78	1.8e-05	25.6	NAD(P)-binding Rossmann-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928615.1
CAAACGAAATGTCCTATTTCCTTTTTTGGCAATACATTCTCACTCTATACTTAATATTTAAATAATTTCTACCAACCTACTTTATAGTACAAATTTCTTAATCTCGTGCCGAAAAGAAATATGACATTTCGTTTGGGAGGAAGGGAGTACTAAACAATTCGGCCCGATTAAAACGAACATTGTGGAGTATATGTTTCTTCTGTCTTGTATCTTGATTGGGATGGTCGAGCAGTTGCGTTGTTTCTGTCAGAATTTATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001958
ATGAGACTCAACAGCTCAATCAAGATTTCCCGGGCCCTTATGTCGGCTGCCGTGAAAGATGGGTGGATTTCCGGTAGTTTGGAATCTGTGCCCAAGGAAACGGCGGAAGCGGTGGTGATAGGCGCCGGAGTGGTGGGCGTGGCGGTGGCGCGTGAGCTTGCCGCGAAAGGTGGGAGGGAGGTTTTGGTTGTGGAGTCGGCGCCGACTTTTGGGACTGGCTCCAGTTCTCGTAACAGTGAAGTTATTCATGCTGGTATTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784598.1
MRLNSSIKISRALMSAAVKDGWISGSLESVPKETAEAVVIGAGVVGVAVARELAAKGGREVLVVESAPTFGTGSSSRNSEVIHAGIYYPPNSLKARLCVRGRHLLYDYCRAHGIPHKQIGKLIVATRPSEVPKLSELMSRGVENGVEGLRMMDGEEAMRVEPQLYCTKALLSPVSGIIDSHSLMLSLLGEAESHGAIFSYNTSVIGGRYEGGRLQLYVCESESLRNWDRASPLKPDLILSPRIVVNSAGLGALPLAKRIH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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