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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004423`

染色体: Chr01 坐标: 62332595-62335354 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004423`
名称	SmilChr01G004423
描述	uncharacterized protein At5g39865-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62332595 - 62335354 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002494`
GeneID	`131002494`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002494`
原始查询	`SmilChr01G004423`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Glutaredoxin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824874]; symbol=AT3G57070; hit=AT3G57070; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Glutaredoxin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824874]; symbol=AT3G57070; hit=AT3G57070; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G57070` (AT3G57070) Glutaredoxin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824874] identity=46.9; qcov=1.02; evalue=1.29e-103; confidence=high
Rice	`Os03g0356400` (OsGRL6) - identity=57.3; qcov=0.379; evalue=2.67e-54; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00462 (Glutaredoxin); PF23733 (GRXCR1-2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002494

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057784958.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057784958.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057784958.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784958.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784958.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62333921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:62334122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:62334290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr1:62334374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr1:62334725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,C64,C66
`Chr1:62334736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,C64,C66
`Chr1:62334742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,C64,C66
`Chr1:62334743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,C64,C66
`Chr1:62334745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B3,B59,C18,C48
`Chr1:62334747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:62334749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,C64,C66
`Chr1:62334796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B29,C50,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784958.1

396 aa

198

396

Glutaredoxin

GRXCR1-2_C

PF00462 Glutaredoxin 252-318 aa PF23733 GRXCR1-2_C 349-395 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784958.1`	Pfam	`PF00462`	Glutaredoxin	Domain	252	318	4.5e-11	43.5	Glutaredoxin
`XP_057784958.1`	Pfam	`PF23733`	GRXCR1-2_C	Domain	349	395	1.1e-18	67.6	GRXCR1/2, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928975.1
CTCGCTGCATTAATTTCTCGCCCCCCTCTCCTCCATTGACAAACCTTCCCCACTAAACACTTCATCTCCACATCTCTCCCCCTCTCTCTCCACATTGCCCTCAAGGTTGCAGAGAGATAAAAAAAGGGGGAAAGCTTCAATCAATCATTGTACTTGGACATCCATAACGGAGAGAGAAAGCAAGGAAGGAAAAAAGGACCATCTTTCACTTTCCGTGGTTAGTTCTCAACTTTGTAAAATCTCCCAAAAATGGGGTGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002494
ATGGGGTGCACTGCTTCACGCCCAGCTAATTTCATCGCTCAACAGGAAGATCCCAACTCCATTTCCTCCTCCGCGCATTCCAATTCGCAGCTGCAGTCTCCTTACAACTCCTTCTCCGACGCTTCTTCCACGCCGGTGTCGAGGACTCTCTCTCTACCGACCCCTTTGATCCACCACCCTCCCCTACGAAAAGGGGACTCCAATCACTTCGTTTCTCTCACATCCACCACCTACGGTTCGCTCGCGCTGGTCTCGCCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784958.1
MGCTASRPANFIAQQEDPNSISSSAHSNSQLQSPYNSFSDASSTPVSRTLSLPTPLIHHPPLRKGDSNHFVSLTSTTYGSLALVSPQFQNLSFSSTRDFAIPPPQMRKPRDLGVSEDPLSPDSVINTWELMEGLDEEEFHYHMVERPKKLGEIEIEMDGDELEKSYEFVEHPVSKPLWKHLSEESLLAKMDINVASSYRRALLGKKSVCEEERELVKPRKTESLGSGSVSSVVADADTEESCCLPCGDDRIVLYYTSLRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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