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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004430`

染色体: Chr01 坐标: 62409971-62413048 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004430`
名称	SmilChr01G004430
描述	protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 10-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62409971 - 62413048 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002634`
GeneID	`131002634`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002634`
原始查询	`SmilChr01G004430`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 10-like
产物	protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 10-like
Arabidopsis	`AT3G57030` (AT3G57030) Calcium-dependent phosphotriesterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824870] identity=63.7; qcov=1.01; evalue=9.94e-180; confidence=high
Rice	`Os03g0750700` (OsSTRL3) - identity=50.3; qcov=0.932; evalue=2.08e-109; confidence=high
GO	GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0016844 (strictosidine synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01731 (Arylesterase); PF03088 (Str_synth); PF08450 (SGL); PF20067 (SSL_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002634

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057785081.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057785081.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057785081.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057785081.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057785081.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62410329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C48
`Chr1:62410343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr1:62411654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B61
`Chr1:62412340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C47
`Chr1:62412478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr1:62412575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:62412598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785081.1

369 aa

184

369

SSL_N

SGL

Str_synth

Arylesterase

PF20067 SSL_N 38-77 aa PF08450 SGL 110-281 aa PF03088 Str_synth 157-244 aa PF01731 Arylesterase 168-279 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785081.1`	Pfam	`PF20067`	SSL_N	Repeat	38	77	1.7e-08	34.9	Strictosidine synthase-like, N-terminal
`XP_057785081.1`	Pfam	`PF08450`	SGL	Repeat	110	281	7.6e-10	39.5	SMP-30/Gluconolactonase/LRE-like region
`XP_057785081.1`	Pfam	`PF03088`	Str_synth	Repeat	157	244	5.6e-33	113.6	Strictosidine synthase
`XP_057785081.1`	Pfam	`PF01731`	Arylesterase	Repeat	168	279	2.5e-06	27.2	Arylesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929098.1
AATTATGCCACAAAATTCTGATCAGATATCTTTTTGCCTCAAAATTTGAATTGATTGGGATTTTTAATTAAAAATATAAGACGAAATTTGAATACTCAGGAGGAATTTTTAAAAAATATTTGTTATTCATTACTTTATTGTAAGAATTTTTTGTTTTGAGTTTGAATTCCATGCAAAAGAAAAAAACAATGAGAATTTATGTTGTTTGACTTGTGGCTGGACAAATAGGTTCTTACCTTGGAAAATCCAGCTAAAGCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002634
ATGAATTCGAAGCTCATCCTCGCTGCAGTAGCACTTGCACTGATCGCGGTGGTGGTCGCCATCGCCGCCGCCTCCGTCTTCACTCCGCCGCCAGTACCAGGCTCGCACGATGTCCTCTCCGCCGCCGAGCTGATCCGCCTCGCTGGAGCCGTCGGGCCCGAGAGCTTGGTCTTCGATCCCAGCGGCGGAGGGCCCTACACCGGCGTCGCCGACGGTCGCATTCTCAAGTGGAACGGTGGAGACTGGGTGGAATTCGCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057785081.1
MNSKLILAAVALALIAVVVAIAAASVFTPPPVPGSHDVLSAAELIRLAGAVGPESLVFDPSGGGPYTGVADGRILKWNGGDWVEFAVTTSKRDACSLPFNPAMEHICGRPLGLKFHQKTGDLYIADAYLGLHVVGPAGGVASPVVTEVEGQRLRFTNDLDIDDEKDVIYFTDSSTEYYRREFMSSVLTMDKTGKFMKYDMSSKEVTVLLRGLAFANGVALSKDHSFVVVVETTRCRVLRFWLEGPNAGTHNIFAELPGYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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