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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004437`

染色体: Chr01 坐标: 62463685-62465291 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004437`
名称	SmilChr01G004437
描述	transcription factor ORG2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62463685 - 62465291 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002690`
GeneID	`131002690`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002690`
原始查询	`SmilChr01G004437`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor ORG2-like
产物	transcription factor ORG2-like
Arabidopsis	`AT3G56970` (bHLH38) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824864] identity=46.9; qcov=0.717; evalue=1.5e-45; confidence=medium
Rice	`Os01g0952800` (OsIRO2) - identity=42.1; qcov=0.664; evalue=5.99e-35; confidence=medium
GO	GO:0000977 (RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity); GO:0090575 (RNA polymerase II transcription regulator complex)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002690

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057785148.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057785148.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057785148.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057785148.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057785148.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62463852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:62464581`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A20,B107,B124,B132,B138,B21,B44,B47,B5,B56,B60,B85,C13,C45,C52,C73,C76,C81,D8
`Chr1:62464694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C85
`Chr1:62464726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B114,B120,B44,C59
`Chr1:62464730`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B130,B39,C31
`Chr1:62464730`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B130,B39,C31
`Chr1:62464759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	50	A15,A18,A19,B1,B104,B11,B112,B114,B115,B117,B120,B121,B125,B126,B13,B130,B132,B136,B138,B31,B35,B39,B40,B42,B44,B47,B56,B65,B67,B71,B89,B96,C13,C27,C35,C36,C38,C4,C43,C45,C48,C51,C56,C59,C65,C70,C73,C74,C76,D8
`Chr1:62464844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B29,B92,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785148.1

247 aa

124

247

HLH

PF00010 HLH 73-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785148.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	73	125	3.8e-14	52.9	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929165.1
GGTAATTAGAGAGGTAGGCAGCAATATATAAATAGAGGTTGTCATCAACAATAGTAACATAACATATCATCAAAACTTGATATCAAAGAGAATCATTTTAGTTTCAAACTGAGAGGAGAAGAAAAAAAATGTTGGCCATTTCTCCTCAAATGTGTTCATATGGGTGGGTTATGGATGATCCCATGATGAGCCATCAACAAGAGAATTTGAGCTATTTTTCTAGAGAGAGAACAGAGACGACCTCAGGTTCCATTGATCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002690
ATGTTGGCCATTTCTCCTCAAATGTGTTCATATGGGTGGGTTATGGATGATCCCATGATGAGCCATCAACAAGAGAATTTGAGCTATTTTTCTAGAGAGAGAACAGAGACGACCTCAGGTTCCATTGATCCCCACTCCCCCTCCTCCAAAATCCCACTCGATTTTGGTAGCAATTTCAACGACGATTTCTTGAATGGAGATGGAAATAAGAAGGTGAAGAAACTCAACCACAATGCAAGCGAGCGTGATCGCCGCAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057785148.1
MLAISPQMCSYGWVMDDPMMSHQQENLSYFSRERTETTSGSIDPHSPSSKIPLDFGSNFNDDFLNGDGNKKVKKLNHNASERDRRKKMNTLYANLRSLLPPEDHSKKLSIPATISRVLKYIPELQREVERLMQQKERFISKISMAAENSSLEFKNHTEKPTQRSSNSAASATRINDGQVVIQISMPKSEKGSISEAISRLEEEGFLMVNASCFESFEGRLFYNLHFQAQEGQVIDAEKLKEKVWPLM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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