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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004454`

染色体: Chr01 坐标: 62661573-62665512 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004454`
名称	SmilChr01G004454
描述	rhomboid-like protein 20
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62661573 - 62665512 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002836`
GeneID	`131002836`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002836`
原始查询	`SmilChr01G004454`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rhomboid-like protein 20
产物	rhomboid-like protein 20
Arabidopsis	`AT3G56740` (AT3G56740) Ubiquitin-associated (UBA) protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824841] identity=71.4; qcov=1.01; evalue=1.52e-143; confidence=high
Rice	`Os01g0268800` (OsRhmbd2) - identity=61.7; qcov=1; evalue=2.61e-114; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00627 (UBA); PF01694 (Rhomboid); PF22562 (UBA_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002836

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057785288.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057785288.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057785288.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057785288.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057785288.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62661863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B65,B93,C52
`Chr1:62662272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C33
`Chr1:62662297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:62663643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B35,C19,C78
`Chr1:62663646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B5,B66
`Chr1:62665179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785288.1

294 aa

147

294

Rhomboid

UBA

UBA_7

PF01694 Rhomboid 49-189 aa PF00627 UBA 253-288 aa PF22562 UBA_7 254-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785288.1`	Pfam	`PF01694`	Rhomboid	Domain	49	189	4.9e-06	27.5	Rhomboid domain
`XP_057785288.1`	Pfam	`PF00627`	UBA	Domain	253	288	2.4e-12	47.1	UBA/TS-N domain
`XP_057785288.1`	Pfam	`PF22562`	UBA_7	Domain	254	291	3.2e-08	34.1	UBA-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929305.1
CGGGTCAGCCCGAGCCCGTTTACTGGCCCAGATAATTTTAGTCGATGACGACGACTCGGAGAGAAGCAGAAAACAGAAAGATTTAGAGAGAGAGAAAATTATCTGGGAGAAATCCGAGAAATACACACACATATACATACAACCGTAGAAGATATCGATTCAAGTATTCAGCGAGGTCGTTGGTTCGCCAGAAAAAAATGAACGGCGGCCCATCTGGTTTTAATAATGCGCCGGTGACAAGGACGATAGTGATTGCGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002836
ATGAACGGCGGCCCATCTGGTTTTAATAATGCGCCGGTGACAAGGACGATAGTGATTGCGAGTGCTCTTTTTACAATCATTTTTGGGATCCAAGGTCGTTCTAGAAACCTCGCTTGGTCTTATCAGGACATTTTCAGGAAACTTCAAATATGGAAGCTCATAGTTTCAGTTTTCGGATTTTCATCTACACCAGAACTTGTTTTTGGAATTTATCTTCTGTACTACTTCCGTGTATTTGAGAGGCAGATTGGTTCTAATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057785288.1
MNGGPSGFNNAPVTRTIVIASALFTIIFGIQGRSRNLAWSYQDIFRKLQIWKLIVSVFGFSSTPELVFGIYLLYYFRVFERQIGSNKYTVFIIFSIAVSILLEVLALLLLKDPSLNILTSGPYGLIFSSFVPFYFDIPVSTRFRVFNLNFSDKTFIYLAGLQLFLSSWKRSMLPGICGILAGSLYRLNVLRIRRMKFPEAIASFFSRLSLPSMGSSSTSATGSSRNVLGSAPTSYPGRQMEGNYPAPTAMEPPEDSISTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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