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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004456`

染色体: Chr01 坐标: 62681442-62684865 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004456`
名称	SmilChr01G004456
描述	uncharacterized SmilChr01G004456
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62681442 - 62684865 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002866`
GeneID	`131002866`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002866`
原始查询	`SmilChr01G004456`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pre-mRNA-splicing factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824839]; symbol=AT3G56720; hit=AT3G56720; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	pre-mRNA-splicing factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824839]; symbol=AT3G56720; hit=AT3G56720; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G56720` (AT3G56720) pre-mRNA-splicing factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824839] identity=43.2; qcov=1; evalue=9.66e-47; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF15477 (SMAP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002866

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057785338.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057785353.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057785338.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057785338.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057785338.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62681461`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A1,A23,B111,B113,B114,B122,B123,B128,B132,B14,B23,B36,B41,B45,B6,B61,B65,B68,B82,B85,B97,B98,B99,C28,C31,C38,C4,C42,C52,C63,C65,C67,C7,C72,C75,D10
`Chr1:62681470`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A15,A21,A22,A7,B111,B117,B128,B129,B28,B35,B42,B43,B44,B57,B60,B67,B72,B80,B84,B99,C19,C48,C60,C78
`Chr1:62681612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr1:62681717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B27,C47
`Chr1:62681777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B90,B91,B92,C57
`Chr1:62681857`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C65
`Chr1:62681857`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C65
`Chr1:62681863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:62681878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr1:62683080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B76
`Chr1:62683166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B76
`Chr1:62683179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785353.1

433 aa

216

433

SMAP

PF15477 SMAP 367-432 aa

XP_057785363.1

433 aa

216

433

SMAP

PF15477 SMAP 367-432 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785353.1`	Pfam	`PF15477`	SMAP	Family	367	432	1.8e-16	61.3	Small acidic protein family
`XP_057785363.1`	Pfam	`PF15477`	SMAP	Family	367	432	1.8e-16	61.3	Small acidic protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929363.1
AAAAACCAATTACTATAACCGAAAATATCTTCCGCTTTTTTGCATTTATCTTTGAACGCTGTCTGATTCCTTTTTAGCTTATTTCAAAAGCACTCGACACAAATAAAAGGGAACCCTAGCGCAAAGCAACAGATTTGCAGCTATTCAATATCCGAATTCAGAGTAGAAATTTATGGATTCAAATGCGCGAGAAAGTTTGGACTCCAAAGCGGAATTCCGGAAACCTTCGAATGATGCTGCTAATAGGAAGTACAGGCGCA...

XM_057929355.1
CTTCCGCTTTTTTGCATTTATCTTTGAACGCTGTCTGATTCCTTTTTAGCTTATTTCAAAAGCACTCGACACAAATAAAAGGGAACCCTAGCGCAAAGCAACAGATTTGCAGCTATTCAATATCCGAATTCAGAGTAGAAATTGCAGTATGGATTCAAATGCGCGAGAAAGTTTGGACTCCAAAGCGGAATTCCGGAAACCTTCGAATGATGCTGCTAATAGGAAGTACAGGCGCAGATCACCTGTTGGCGGATCATCGT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131002866
ATGGATTCAAATGCGCGAGAAAGTTTGGACTCCAAAGCGGAATTCCGGAAACCTTCGAATGATGCTGCTAATAGGAAGTACAGGCGCAGATCACCTGTTGGCGGATCATCGTCTTCTGATGGGAGTCCACGCAATGGGCGCAGCTTAAGTCCAGTCCCATCAAGGAAGGAAACTGCTAGAGTTGCTGATGATAAACGAAAAAGGGATGATGATAGGAATCAGTCTGGCCGTAGCGATGAGCCATATAAATACTCTGATCG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057785338.1
MDSNARESLDSKAEFRKPSNDAANRKYRRRSPVGGSSSSDGSPRNGRSLSPVPSRKETARVADDKRKRDDDRNQSGRSDEPYKYSDRQSSRSHYRHDDRSRRDRHVDDYDRGYPKSSYRSRDSRENNNLDYSRSEKDYKSRDFVNEADTYSHGKSDGLGSRNKDKSSYDRTGSGRRHAAAEERDRDRNREGKADHYGKTDNKKSSVDRKSDRSPAYEESRGLRNESFARRDSSGPRVKEAAWRDSKELDSERHASDEKRR...

XP_057785346.1
MDSNARESLDSKAEFRKPSNDAANRKYRRRSPVGGSSSSDGSPRNGRSLSPVPSRKETARVADDKRKRDDDRNQSGRSDEPYKYSDRQSSRSHYRHDDRSRRDRHVDDYDRGYPKSSYRSRDSRENNNLDYSRSEKDYKSRDFVNEADTYSHGKSDGLGSRNKDKSSYDRTGSGRRHAAAEERDRDRNREGKADHYGKTDNKKSSVDRKSDRSPAYEESRGLRNESFARRDSSGPRVKEAAWRDSKELDSERHASDEKRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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