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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004458`

染色体: Chr01 坐标: 62697089-62699251 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004458`
名称	SmilChr01G004458
描述	putative F-box protein At5g55150
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62697089 - 62699251 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002901`
GeneID	`131002901`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002901`
原始查询	`SmilChr01G004458`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At5g55150
产物	putative F-box protein At5g55150
Arabidopsis	`AT2G26160` (AT2G26160) F-box SKIP23-like protein (DUF295) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817156] identity=24.7; qcov=0.948; evalue=5.27e-13; confidence=weak
Rice	`Os03g0802100` (OsFbox176) - identity=26.4; qcov=1.14; evalue=7.41e-28; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF03478 (Beta-prop_KIB1-4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002901

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057785375.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057785375.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057785375.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057785375.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057785375.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62697944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:62698082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B27,C47
`Chr1:62698161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:62698168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C47
`Chr1:62698187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr1:62698203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C27
`Chr1:62698254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,C25,D5
`Chr1:62698271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:62698329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:62698444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:62698516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C11,C69
`Chr1:62698516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785375.1

367 aa

184

367

F-box

Beta-prop_KIB1-4

PF00646 F-box 4-37 aa PF03478 Beta-prop_KIB1-4 66-336 aa

XP_057785378.1

367 aa

184

367

F-box

Beta-prop_KIB1-4

PF00646 F-box 4-37 aa PF03478 Beta-prop_KIB1-4 66-336 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785375.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	4	37	6.3e-05	23.4	F-box domain
`XP_057785375.1`	Pfam	`PF03478`	Beta-prop_KIB1-4	Repeat	66	336	1.2e-48	166.5	KIB1-4 beta-propeller
`XP_057785378.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	4	37	6.3e-05	23.4	F-box domain
`XP_057785378.1`	Pfam	`PF03478`	Beta-prop_KIB1-4	Repeat	66	336	1.2e-48	166.5	KIB1-4 beta-propeller

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929392.1
TTTTGAGCCCATTTCATTATAATTTTTATCTGGCAACTCTGTCGCACTGGAAAATGCGGTGGTATAGTGGAGTTGGCTGTAGATCAAAGCGAAGGAAGTCAGCTGAAATTTGTATTCTGCCCTAAAGGAAGCTGTGGTTTGAATAGGTTTCTGTTTAGGCTCAGCAATGGCAGATTGGTCCAGACTTCCATATGATATCATTCACAAGGTCTCCACATATATAACAGCCATTGAGGATTTCCTTGCATTTTCAGCTGTTT...

XM_057929395.1
TATAGTGGAGTTGGCTGTAGATCAAAGCGAAGGAAGTCAGCTGAAATTTGTATTCTGCCCTAAAGGAAGCTGTGGTTTGAATAGGTTTCTGTTTAGGTATTTATCGTCTTCTAATTGGAGAATTGCGGTCAAATAATAGGCGTTTGTGCAATCGTATTTGCTCAGCAATGGCAGATTGGTCCAGACTTCCATATGATATCATTCACAAGGTCTCCACATATATAACAGCCATTGAGGATTTCCTTGCATTTTCAGCTGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131002901
ATGGCAGATTGGTCCAGACTTCCATATGATATCATTCACAAGGTCTCCACATATATAACAGCCATTGAGGATTTCCTTGCATTTTCAGCTGTTTGTTGCTCCTGGAGATCAGTTTATTTGGCTAAACAATGGCAATTGGGTCCTCAGATTCCAATGTTGATGTTCTCTGACTATGAAAACAGTGGATTTAGAAGCTTCATTAGCTTGTGCAGAAATAGGGTTTACAGTACTGAGCTGCCTGAGGTTCGTGGCAGACGGTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057785375.1
MADWSRLPYDIIHKVSTYITAIEDFLAFSAVCCSWRSVYLAKQWQLGPQIPMLMFSDYENSGFRSFISLCRNRVYSTELPEVRGRRCWGSSSGWIVTIGDDLQIHLLNPFTRVSICLPSKSSLQIQFSEILDWHDIIQKVFVFRNPFNSGVNEEGLLVLIIYSPLNQLAFCRPGYSSWKNIRDTNDAGFIDAACLGDRIYAIRDLGSLIAIDIESLAVVNITGQHHPRHVSLSLLPRWDWERLFLVESSGELWIVLQRHK...

XP_057785378.1
MADWSRLPYDIIHKVSTYITAIEDFLAFSAVCCSWRSVYLAKQWQLGPQIPMLMFSDYENSGFRSFISLCRNRVYSTELPEVRGRRCWGSSSGWIVTIGDDLQIHLLNPFTRVSICLPSKSSLQIQFSEILDWHDIIQKVFVFRNPFNSGVNEEGLLVLIIYSPLNQLAFCRPGYSSWKNIRDTNDAGFIDAACLGDRIYAIRDLGSLIAIDIESLAVVNITGQHHPRHVSLSLLPRWDWERLFLVESSGELWIVLQRHK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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