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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004463`

染色体: Chr01 坐标: 62722437-62728825 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004463`
名称	SmilChr01G004463
描述	DNA gyrase subunit B, chloroplastic/mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62722437 - 62728825 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002955`
GeneID	`131002955`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002955`
原始查询	`SmilChr01G004463`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA gyrase subunit B, chloroplastic/mitochondrial-like
产物	DNA gyrase subunit B%2C chloroplastic/mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G04130` (GYRB2) DNA GYRASE B2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830291] identity=79.4; qcov=0.92; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0268300` (GYRB) - identity=77.2; qcov=0.904; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003918 (DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005694 (chromosome); GO:0006265 (DNA topological change)
KEGG	-
Pfam	PF00204 (DNA_gyraseB); PF00986 (DNA_gyraseB_C); PF01751 (Toprim); PF02518 (HATPase_c)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002955

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057785429.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057785429.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057785429.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057785429.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057785429.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62723428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:62723804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr1:62724033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B122,B56,B96,C39,D4
`Chr1:62724033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B56,B96,C39,D4
`Chr1:62724918`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	99	A1,A11,A14,A16,A18,A2,A20,A4,A6,A7,A8,B10,B101,B102,B106,B107,B109,B112,B113,B118,B120,B121,B123,B125,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B136,B138,B14,B16,B18,B23,B26,B27,B3,B32,B39,B45,B48,B49,B5,B50,B59,B6,B60,B62,B68,B69,B80,B81,B82,B83,B85,B87,B90,B91,B92,B95,B97,B98,C1,C12,C13,C17,C20,C3,C30,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C48,C49,C5,C50,C52,C53,C56,C57,C59,C61,C63,C65,C67,C74,C80,C83,C87,D11,D3,D5
`Chr1:62725198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,D11
`Chr1:62725995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C52
`Chr1:62726419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:62727915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785429.1

739 aa

370

739

HATPase_c

DNA_gyraseB

Toprim

DNA_gyraseB_C

PF02518 HATPase_c 125-271 aa PF00204 DNA_gyraseB 323-492 aa PF01751 Toprim 521-620 aa PF00986 DNA_gyraseB_C 665-726 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785429.1`	Pfam	`PF02518`	HATPase_c	Domain	125	271	1.8e-17	64.5	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
`XP_057785429.1`	Pfam	`PF00204`	DNA_gyraseB	Domain	323	492	2.5e-55	187.4	DNA gyrase B
`XP_057785429.1`	Pfam	`PF01751`	Toprim	Family	521	620	4.6e-18	65.9	Toprim domain
`XP_057785429.1`	Pfam	`PF00986`	DNA_gyraseB_C	Family	665	726	3.4e-24	85.5	DNA gyrase B subunit, carboxyl terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929446.1
CAAAAAAAAAAAAGTCTCATCCCTTCCCCCCAACCAAAGAGTGTGAGAATGAGAAGGAAGGTTTTTATCTTCAGTCTCAAGAATCTCGACCCCTTAAAACCCTGAACCCAAAACCTCAAATTTCCAAACAAGAACACCGCCACAAATTTTACAGTGAAAACCCAAAACCATTTATGAATGGCCCTTCTTCTCAAGCCAAATACTTCTCTTAAACGCATGGCCTCTCGTTTTTATGCCTTTTCTCCTTCTTCTACTCATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002955
ATGGCCCTTCTTCTCAAGCCAAATACTTCTCTTAAACGCATGGCCTCTCGTTTTTATGCCTTTTCTCCTTCTTCTACTCATTCTTTTCATTCCCGCGCCCGCTCTACTCTCGCCGTATCCTCTTCTTTCTCTCTATCTACGCCCTCTTTCATACTTCTTACCAGCAGAGCTAGTGATAGGTTGAAGAAGCTTTCTAGCAACTGTTTGCCATGTCATGCTGTGATTCCAAGAGCATTCATGTCATCAAGCTCCAGCACCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057785429.1
MALLLKPNTSLKRMASRFYAFSPSSTHSFHSRARSTLAVSSSFSLSTPSFILLTSRASDRLKKLSSNCLPCHAVIPRAFMSSSSSTEAVRESKASKEYGSEQIQVLEGLDPVRKRPGMYIGSTGSRGLHHLVYEILDNAIDEAQAGFASKIDVILLADNSVCITDNGRGIPTDMHPSTKKSSLETVLTVLHAGGKFGGTSSGYSVSGGLHGVGLSVVNALSEVLEVTIWRNGKEYKQKYSRGKPMAKLVSRELPADMKDH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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