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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004471`

染色体: Chr01 坐标: 62801628-62804776 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004471`
名称	SmilChr01G004471
描述	probable auxin efflux carrier component 1b
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62801628 - 62804776 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003054`
GeneID	`131003054`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003054`
原始查询	`SmilChr01G004471`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable auxin efflux carrier component 1b
产物	probable auxin efflux carrier component 1b
Arabidopsis	`AT1G73590` (PIN1) Auxin efflux carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843693] identity=64.6; qcov=1.08; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0232300` (PIN1C) - identity=69.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009926 (auxin polar transport); GO:0010315 (auxin export across the plasma membrane); GO:0010329 (auxin efflux transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF03547 (Mem_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003054

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057785507.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057785507.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057785507.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057785507.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057785507.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62802855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:62803512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr1:62803599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B109,B47,D2
`Chr1:62803601`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A20,B109,B47,D2
`Chr1:62803601`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A20,B109,B47,D2
`Chr1:62803626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr1:62803934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:62803938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr1:62804210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr1:62804237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:62804270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr1:62804451`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B119

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785507.1

596 aa

298

596

Mem_trans

PF03547 Mem_trans 9-589 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785507.1`	Pfam	`PF03547`	Mem_trans	Family	9	589	2.3e-124	415.2	Membrane transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929524.1
TTTCTTCTCTTTCCCATCAAAAGACTATAAAAAAGCTTCTTAAAAGCCCTCAGCTTTTATTTCTTTGTCTGCCATTTATTTCCCTTAAATTATTTCACTTCTCCTCCCCCTATATCTCCTCACTGCGCAGTACCTCCCCAAAATCAGGCCCCAAATCCACCCTCCATCATTACTCCTGCACTACCTTCCTACCGCCATTGAAACTCGAATGCCCTAATTTTCCACAGCTCATTCCTCCTCCCACACCTTCCCCAACGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131003054
ATGATCAAGGCCTCCGATCTCTACCACGTGCTCACCGCCGTGGTGCCGCTCTACGTGGCCATGATCCTGGCCTACGGCTCCGTGAAATGGTGGAAGATCTTCACCCCGGACCAGTGCTCCGGCATCAACCGGTTTGTGGCCCTCTTCGCCGTCCCGCTGCTCTCCTTCCACTTCATCTCCACCAACGACCCCTACGCCATGAACTACCGCTTCATCGCCGCCGACACGCTTCAGAAGGTGATCGTCCTCGCCGTGCTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057785507.1
MIKASDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFTPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISTNDPYAMNYRFIAADTLQKVIVLAVLAVWSRISARGSLEWSITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGSDSGSLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARMLIAEQFPDTAGSIISFRVDTDIISLDGKEPLQTEAEVGEDGKLHVTVRKSTSSRSEIFSRRSHGPNSGLSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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