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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr01G004480

染色体: Chr01 坐标: 62908174-62909301 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr01G004480
名称SmilChr01G004480
描述uncharacterized SmilChr01G004480
染色体 / SeqIDChr01 / NC_080387.1
坐标与链方向62908174 - 62909301 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131004055
GeneID131004055
locus_tag-
NCBI NameLOC131004055
原始查询SmilChr01G004480

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述SsrA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841253]; symbol=AT1G48330; hit=AT1G48330; species=arabidopsis; confidence=medium
产物SsrA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841253]; symbol=AT1G48330; hit=AT1G48330; species=arabidopsis; confidence=medium
ArabidopsisAT1G48330 (AT1G48330)
SsrA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841253]
identity=54.5; qcov=0.917; evalue=7.22e-22; confidence=medium
RiceOs01g0288200
-
identity=50; qcov=1.06; evalue=2.78e-15; confidence=low
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131004055

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Mitochondrion 线粒体 0.80000 XP_057786624.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.60000 XP_057786624.1
3 Mitochondrion membrane 线粒体膜 0.20000 XP_057786624.1
4 Mitochondrion outer membrane 线粒体外膜 0.20000 XP_057786624.1
5 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057786624.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057930641.1
GAGAAGCTAATTAGGGGCGGGTTGACAAATGACAAGGCGTCTCGTTTAGAGAAAGCAAAGTATGGGGCAGTTCACATGCATGGTTGGGGCATTTGGGAAGCGTGCGGCATGTGCAAAGCTGCAGCTACGCATAATTGTGTAGGTTTATATATTATTGGTTGATTATTAGATGATGATTAACCCACAGCTTATGTTACGGATCTTGCCTTGCCTTGGAGCTACACACTGCATACTTATAGTTTACCCTCTTATATAAAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131004055
ATGGCTTCCTGGGTTCGAACAATCACTTCTCCTTTCAGAAAAGCTTGTACTTTCTTCAACCAAAACCAACCTCGAGACAAGAAGTCCCAACAAGGGAGACAAGAAAAGTGTATCATGGATTTGCAAGGGGAAGTCATGGCTTGTGCGTACGAGGATGTGCAGGTTATGTGGTCTATTTTGGACAAGAACAAGCCCAGAACCTGCACTCTTACTTCTTAA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057786624.1
MASWVRTITSPFRKACTFFNQNQPRDKKSQQGRQEKCIMDLQGEVMACAYEDVQVMWSILDKNKPRTCTLTS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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