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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004485`

染色体: Chr01 坐标: 62982004-62983723 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004485`
名称	SmilChr01G004485
描述	transcription factor MYBC1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62982004 - 62983723 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003818`
GeneID	`131003818`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003818`
原始查询	`SmilChr01G004485`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYBC1-like
产物	transcription factor MYBC1-like
Arabidopsis	`AT3G10760` (AT3G10760) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820245] identity=53.5; qcov=1.27; evalue=1.11e-85; confidence=high
Rice	`Os05g0412000` - identity=60.2; qcov=0.633; evalue=7.39e-48; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003818

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057786356.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057786356.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057786356.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057786356.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057786356.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62982788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr1:62982862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:62982913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:62982989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C83
`Chr1:62983015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:62983036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B78,B86,B9
`Chr1:62983232`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A4
`Chr1:62983232`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786356.1

270 aa

135

270

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 92-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057786356.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	92	141	5.7e-09	36.7	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057930373.1
AATTGAAAGGAAAAAAAGAAAACCCCTTTTTTAGTAGTGACACAAACTCTCAAGAAACTCAAAAGCATAAAAAGAACCCCTAAATCCTGGAAAAAATAGAACAAAACACACACACAGCACATAAAAATCATAAGAAAAGGCATCCACAACAGTAACCTTAATAACATCTGAAAAGAAGAAAACAAGATCCACCTCGATCACCCCTCCCCCCCTTCACCCACAAACCTCTCTCTCTGTCTTTCTTGATTCACAGAGAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131003818
ATGAGGGAAGATGAGTCAAATTGGTTTTCGAAATGGGAGGAAGAATTGCCGTCGCCGGAGGATCTGATGCCCTTATCCCAATCCCTAATAACCCCTGATCTAGCTCTGGCCTTCAACATTCACAACCCCCACCAGCAGCAATCGCTCCACCCGCCCCCGCCGCCCCCCCTGCCTCCGCAGCCCAATTCCTCGGCGGAATTCGACTCCCCGGAGCTCAGCGGCGCGGGGGGCGGGGGCGGAGACGAGCCGGCGCGGACCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057786356.1
MREDESNWFSKWEEELPSPEDLMPLSQSLITPDLALAFNIHNPHQQQSLHPPPPPPLPPQPNSSAEFDSPELSGAGGGGGDEPARTLKRPRLVWTPQLHKRFVDAVAHLGIKNAVPKTIMQLMSVDGLTRENVASHLQKYRLYLKRMQGISSNGAAGANSPAALSDAATDHLFASSPVPPHFLHPARATSDHFLPFVPVAAMQQIHHQQFRHFGSSPPNAQFEHPFIRQPQPQPQRMPTNTPPPAYADDLDPPNAANGRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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