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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004487`

染色体: Chr01 坐标: 63006485-63009676 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004487`
名称	SmilChr01G004487
描述	bZIP transcription factor 17-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63006485 - 63009676 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003199`
GeneID	`131003199`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003199`
原始查询	`SmilChr01G004487`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	bZIP transcription factor 17-like
产物	bZIP transcription factor 17-like
Arabidopsis	`AT2G40950` (BZIP17) Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818694] identity=50.2; qcov=0.861; evalue=1.25e-156; confidence=high
Rice	`Os07g0644100` (OsbZIP60) - identity=45; qcov=0.66; evalue=6.74e-97; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006990 (GO:0006990)
KEGG	-
Pfam	PF00170 (bZIP_1); PF07716 (bZIP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003199

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057785661.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057785661.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057785661.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057785661.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057785661.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63006694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C52
`Chr1:63006752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:63006776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,D7
`Chr1:63007114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,C39,D5
`Chr1:63007695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B122
`Chr1:63007700`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B121
`Chr1:63007700`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B121
`Chr1:63008329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C5
`Chr1:63009417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C15
`Chr1:63009477`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A21,B28,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785661.1

777 aa

388

777

bZIP_2

bZIP_1

PF07716 bZIP_2 287-334 aa PF00170 bZIP_1 287-347 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785661.1`	Pfam	`PF07716`	bZIP_2	Coiled-coil	287	334	1.3e-05	25.8	Basic region leucine zipper
`XP_057785661.1`	Pfam	`PF00170`	bZIP_1	Coiled-coil	287	347	7.4e-12	45.9	bZIP transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929678.1
ATCCACGCAGAGATGCGGTGCAGCCACACGCGCGCGTGCGATATAAACTAGTCAGCCGTTTGGAGTTTAGACGCTGCTCCCCTTCCTAAAACCTGAGAAAATTCCCCCAATTTCCTCATCTCCAATTTCACACACACCACACGCACTCCGAGTCTCCGACGAAATGGCTGAAGCTACGGTGGTCGCCGTGGATCCACCGACGGAACCGCCGCCGGATTTCGGTGATTTCGGATGCGGCCTGCAAATTGCGCCTCTCGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131003199
ATGGCTGAAGCTACGGTGGTCGCCGTGGATCCACCGACGGAACCGCCGCCGGATTTCGGTGATTTCGGATGCGGCCTGCAAATTGCGCCTCTCGACGACGGTTTCTTCTCGCATCACGTCTTCAACGGCGATGGTGTGGCGGGGGAAAACGGTAGAGACGACGTCGTCGTGCTCGAAGACCTCGATTTCGATTTTTCCTTCGACGATCTCGGCCTTCCCCCGGCAGACGATCTCGATCACCTTCTTAACCCCTCGCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057785661.1
MAEATVVAVDPPTEPPPDFGDFGCGLQIAPLDDGFFSHHVFNGDGVAGENGRDDVVVLEDLDFDFSFDDLGLPPADDLDHLLNPSQLRQFHSQPRVDPSFAQVGSNYEQMHSVFKSSSSELRHLSGDGDFSGNRSCDGSGLMNSTSPDTESQQISAYLNMPSPESNGSNRGSADNGDDDGKGLNCPSPDSQGSGNFESHVSEDSNNCVARSVSSSPNSSNSSVRNSVVDQKIKLEDPASNNSSISLLKRKKEGEDLTHSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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