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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004491`

染色体: Chr01 坐标: 63052343-63053747 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004491`
名称	SmilChr01G004491
描述	cysteine proteinase inhibitor A-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63052343 - 63053747 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004018`
GeneID	`131004018`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004018`
原始查询	`SmilChr01G004491`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine proteinase inhibitor A-like
产物	cysteine proteinase inhibitor A-like
Arabidopsis	`AT3G12490` (CYSB) cystatin B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820428] identity=53.7; qcov=0.931; evalue=1.79e-42; confidence=medium
Rice	`Os01g0270100` - identity=57.1; qcov=0.729; evalue=1.1e-36; confidence=medium
GO	GO:0004869 (cysteine-type endopeptidase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00031 (Cystatin); PF16845 (SQAPI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004018

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057786574.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057786581.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057786574.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057786574.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057786574.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63052962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B63,B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786574.1

152 aa

152

Cystatin

SQAPI

PF00031 Cystatin 43-128 aa PF16845 SQAPI 53-128 aa

XP_057786581.1

144 aa

144

Cystatin

SQAPI

PF00031 Cystatin 43-128 aa PF16845 SQAPI 53-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057786574.1`	Pfam	`PF00031`	Cystatin	Domain	43	128	9e-19	68.3	Cystatin domain
`XP_057786574.1`	Pfam	`PF16845`	SQAPI	Domain	53	128	2.7e-23	82.8	Aspartic acid proteinase inhibitor
`XP_057786581.1`	Pfam	`PF00031`	Cystatin	Domain	43	128	8e-19	68.4	Cystatin domain
`XP_057786581.1`	Pfam	`PF16845`	SQAPI	Domain	53	128	2.5e-23	83.0	Aspartic acid proteinase inhibitor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057930598.1
ATGAAATCAAAGAGCATCGATTTAAGGAAAACCATTCACTTCAGCTTGCTTTTGGCGGTGGTTGCCGTAGTTTGTCAGATCGGATTCTGTAGCGAATCGCCGGAGCAGACGATAACGATGAAGCTCGGCGGCCTGCGCAATACGGCTCAAAACAGCCTCGAAATTGAGGATATCGGCCGGTTTGCTGTTCAAGAACATAATAAGAATCAGAACACCTTGCTTGAATTTGGAAGAGTAGTGAATGCCAAAGAACAGGTAGT...

XM_057930591.1
ATGAAATCAAAGAGCATCGATTTAAGGAAAACCATTCACTTCAGCTTGCTTTTGGCGGTGGTTGCCGTAGTTTGTCAGATCGGATTCTGTAGCGAATCGCCGGAGCAGACGATAACGATGAAGCTCGGCGGCCTGCGCAATACGGCTCAAAACAGCCTCGAAATTGAGGATATCGGCCGGTTTGCTGTTCAAGAACATAATAAGAATCAGAACACCTTGCTTGAATTTGGAAGAGTAGTGAATGCCAAAGAACAGGTAGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131004018
ATGAAATCAAAGAGCATCGATTTAAGGAAAACCATTCACTTCAGCTTGCTTTTGGCGGTGGTTGCCGTAGTTTGTCAGATCGGATTCTGTAGCGAATCGCCGGAGCAGACGATAACGATGAAGCTCGGCGGCCTGCGCAATACGGCTCAAAACAGCCTCGAAATTGAGGATATCGGCCGGTTTGCTGTTCAAGAACATAATAAGAATCAGAACACCTTGCTTGAATTTGGAAGAGTAGTGAATGCCAAAGAACAGGTAGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057786574.1
MKSKSIDLRKTIHFSLLLAVVAVVCQIGFCSESPEQTITMKLGGLRNTAQNSLEIEDIGRFAVQEHNKNQNTLLEFGRVVNAKEQVVAGKMYHLTVEAVDGGQNKIYEAKVWVKPWMNFKQLQEFKEVRDNPTTSSALGIERVLKRMVAFKY

XP_057786581.1
MKSKSIDLRKTIHFSLLLAVVAVVCQIGFCSESPEQTITMKLGGLRNTAQNSLEIEDIGRFAVQEHNKNQNTLLEFGRVVNAKEQVVAGKMYHLTVEAVDGGQNKIYEAKVWVKPWMNFKQLQEFKEVRDNPTTSSALGIERGH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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