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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004492`

染色体: Chr01 坐标: 63054041-63058804 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004492`
名称	SmilChr01G004492
描述	protein kinase and PP2C-like domain-containing protein
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63054041 - 63058804 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003271`
GeneID	`131003271`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003271`
原始查询	`SmilChr01G004492`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein kinase and PP2C-like domain-containing protein
产物	protein kinase and PP2C-like domain-containing protein
Arabidopsis	`AT2G40860` (AT2G40860) protein kinase family protein / protein phosphatase 2C (PP2C) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818684] identity=65.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0541900` (OsPP2C04) - identity=66.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00481 (PP2C); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003271

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057785766.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057785766.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057785766.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057785766.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057785766.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63056943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B65
`Chr1:63056959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B65
`Chr1:63057623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C18
`Chr1:63057667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:63057984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785766.1

654 aa

327

654

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PP2C

PF00069 Pkinase 31-308 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 33-311 aa PF00481 PP2C 391-637 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785766.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	31	308	4e-48	164.8	Protein kinase domain
`XP_057785766.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	33	311	8.3e-42	144.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057785766.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	391	637	8.2e-65	219.7	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009094598.1
ATGAATAATTGCAGACGAGAGACGACGACACTTGCATTTTCACTCCTTCCATTTTCATCCTCTCAATAAATTCCAAAGAGGCATAAACACACACACACACACACACACACAGTATTTGCAAGAATTGGTCGAAGGAAATGGTTTTGGAAATCATGGAACCCAACACTTGCATCAGGGGTTGTTGCCACAGCCAAACAATCCCTCTCCATCTCCGCCCCTCTTCCTATTCTCTTTCTTCCCCAATCGCCAGAGGTGCAGAG...

XR_009094600.1
ATGAATAATTGCAGACGAGAGACGACGACACTTGCATTTTCACTCCTTCCATTTTCATCCTCTCAATAAATTCCAAAGAGGCATAAACACACACACACACACACACACACAGTATTTGCAAGAATTGGTCGAAGGAAATGGTTTTGGAAATCATGGAACCCAACACTTGCATCAGGGGTTGTTGCCACAGCCAAACAATCCCTCTCCATCTCCGCCCCTCTTCCTATTCTCTTTCTTCCCCAATCGCCAGAGGTGCAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131003271
ATGGTTTTGGAAATCATGGAACCCAACACTTGCATCAGGGGTTGTTGCCACAGCCAAACAATCCCTCTCCATCTCCGCCCCTCTTCCTATTCTCTTTCTTCCCCAATCGCCAGAGGTGCAGAGAGCGTGGTGTATGAAGCCGTACTCGACGGTAAAAAAGTGGCGGCGAAGAAGCCAATTCTGTCTACTTCCGATGATCTCGATAAGTTCCACAGAGAGTTGCAGCTGCTTAGCAAGTTGGATCATCCGGGAATAATGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057785766.1
MVLEIMEPNTCIRGCCHSQTIPLHLRPSSYSLSSPIARGAESVVYEAVLDGKKVAAKKPILSTSDDLDKFHRELQLLSKLDHPGIMKLVAAHARPPNYMFFFELYAAGSLSQKLHVEEYSLSIGQAMEITTLLAKALLYLHSLGIVHRDVKPANILLNENLQPHLADFGLAEYTKDLEQVSVRNWKSSGKPTGGFHKKNMVGTLIYMAPEVLRKEIQTEKSDVYSFGVTVNELLTGVVPYTDLRAEAQAHTVLEMNYTEQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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