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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004497`

染色体: Chr01 坐标: 63075848-63076775 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004497`
名称	SmilChr01G004497
描述	3'-5' exonuclease-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63075848 - 63076775 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003948`
GeneID	`131003948`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003948`
原始查询	`SmilChr01G004497`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3'-5' exonuclease-like
产物	3'-5' exonuclease-like
Arabidopsis	`AT3G12460` (AT3G12460) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820425] identity=30.6; qcov=1.01; evalue=2.53e-21; confidence=low
Rice	`Os01g0660800` - identity=49.2; qcov=0.903; evalue=4.26e-54; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006139 (nucleobase-containing compound metabolic process); GO:0008408 (3'-5' exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF01612 (DNA_pol_A_exo1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003948

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057786504.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057786504.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057786504.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057786504.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057786504.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63075970`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A25,A6,B11,B139,B17,B20,B22,B24,B35,B37,B40,B5,B54,B57,B67,B7,B77,B97,C1,C14,C15,C24,C28,C31,C34,C46,C51,C54,C67,C73,C8,C81,C83
`Chr1:63076013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr1:63076057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:63076214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr1:63076278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr1:63076393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,C49,C85
`Chr1:63076498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786504.1

207 aa

104

207

DNA_pol_A_exo1

PF01612 DNA_pol_A_exo1 33-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057786504.1`	Pfam	`PF01612`	DNA_pol_A_exo1	Domain	33	198	1.3e-12	48.6	3'-5' exonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057930521.1
ATTTTGGAGTTTTCAAAATGAACGAAATTTTACTTCCATTGTGTAGAATGGATATTCCTAATTAATTGCAGAAACACAAAAATTCGATGATAATGTTATCACTGAAATATATTTGCATTTTTTTTAAATATATTAATTCTGAGTAGATTTAAATGTAACTAAACGCCGAAATTAGTCGTAGCGTAACAAACAGTCAGCGCGCCGTGCAGCGGAAATAAAATCAGATGGCAATCCACTGCCACTGCCAGCGGCCCTCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131003948
ATGGCAATCCACTGCCACTGCCAGCGGCCCTCCGCCGCCTACAACGTCGTCTTCTCCGGTGACGTCGTTTACGCCACAGTCACGCGCGACCCCGCCGCCGTCTCCCAGTGGATTCGCGATGTCAGCTCCCTCTACGGCCACCGCCTCACCGTCGGCCTCGACATCGAGTGGCGCCCAAACTACCTCCGCGGTGAACAGAACCCCGCCGCCACACTCCAGCTCTGCGTCGGGCGCTGCTGCCTGATCTACCTGCTCATCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057786504.1
MAIHCHCQRPSAAYNVVFSGDVVYATVTRDPAAVSQWIRDVSSLYGHRLTVGLDIEWRPNYLRGEQNPAATLQLCVGRCCLIYLLIHSPYFPVQLIRFLSYSDHNFVGIGVKSDLRKLQRDHRLGYGAKTVDLGRLAADVYKMKELKNVGLKNLARFVLGKEMEKPKSVTRSRWDNPRLTADQVHYACIDAYVSFEIGRVLNACVFG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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