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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004499`

染色体: Chr01 坐标: 63088160-63089143 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004499`
名称	SmilChr01G004499
描述	uncharacterized SmilChr01G004499
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63088160 - 63089143 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011323`
GeneID	`131011323`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011323`
原始查询	`SmilChr01G004499`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0737600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0737600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G12470` (AT3G12470) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820426] identity=38.4; qcov=0.848; evalue=4.14e-17; confidence=low
Rice	`Os01g0737600` - identity=45.9; qcov=0.758; evalue=8.64e-30; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008408 (3'-5' exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011323

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795092.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057795092.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057795092.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795092.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795092.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63088219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A11,A6,B12,B120,B128,B19,B29,B32,B65,B66,B75,B84,B86,C16,C23,C33,C44,C49,C85,D7
`Chr1:63088220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A1,A13,A20,A25,B125,B128,B136,B44,C12,C30,C40,C42,C58,C74,C79,C83
`Chr1:63088238`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	45	A13,A20,A25,B110,B125,B127,B128,B135,B136,B14,B16,B24,B25,B36,B56,B62,B63,B65,B69,B83,B85,B87,B96,C12,C16,C29,C30,C38,C4,C40,C42,C46,C48,C57,C58,C59,C65,C67,C71,C72,C73,C76,C83,C9,D8
`Chr1:63088762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C80
`Chr1:63088791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C80
`Chr1:63088797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B25,B33,B68,C80
`Chr1:63088803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B33,B68
`Chr1:63088809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C80
`Chr1:63088813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,D3
`Chr1:63088826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C80
`Chr1:63088840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:63089019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939109.1
TCGAAAGAAAAAAAAAAATCTCCATCACTTCAACAATGGCGATCACCATCACGGAGAACAGAACATTCGCATACTCTTCACAGACCTACAACGTCCAGTTCTTCACGGATGACATCCACACCACCGTCACCGCCGACGCCGCCGTCGTCACCGACTGGATCAACGGCATCCAGCCTCGCCGAGTCCTCATCGTCGGCCTCGACGCGGAGTGGCGCCCCAGCTTCGGCTCTCCACAGTACAATCCCGTCGCGACGCTGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011323
ATGGCGATCACCATCACGGAGAACAGAACATTCGCATACTCTTCACAGACCTACAACGTCCAGTTCTTCACGGATGACATCCACACCACCGTCACCGCCGACGCCGCCGTCGTCACCGACTGGATCAACGGCATCCAGCCTCGCCGAGTCCTCATCGTCGGCCTCGACGCGGAGTGGCGCCCCAGCTTCGGCTCTCCACAGTACAATCCCGTCGCGACGCTGCAGCTCTGCGTCGGCAACCGCTGCCTCATCTACCAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795092.1
MAITITENRTFAYSSQTYNVQFFTDDIHTTVTADAAVVTDWINGIQPRRVLIVGLDAEWRPSFGSPQYNPVATLQLCVGNRCLIYQIIHSVWIPASLASFLSDSRQFGDVTFVGVGIKTDLEKLQRDYGIGGVLKITICISDVAVLFKVTWQLLFKVTWQLLFKVTWQLLFKLLFKLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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