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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004501`

染色体: Chr01 坐标: 63118859-63119747 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004501`
名称	SmilChr01G004501
描述	3'-5' exonuclease-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63118859 - 63119747 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003932`
GeneID	`131003932`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003932`
原始查询	`SmilChr01G004501`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3'-5' exonuclease-like
产物	3'-5' exonuclease-like
Arabidopsis	`AT3G12460` (AT3G12460) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820425] identity=29.2; qcov=1.01; evalue=2.79e-26; confidence=low
Rice	`Os01g0737700` - identity=51.3; qcov=0.899; evalue=1.59e-62; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006139 (nucleobase-containing compound metabolic process); GO:0008408 (3'-5' exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF01612 (DNA_pol_A_exo1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003932

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057786485.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057786485.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057786485.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057786485.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057786485.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63119300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,C49,C85
`Chr1:63119337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,C49,C85
`Chr1:63119358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C19,C76
`Chr1:63119536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786485.1

217 aa

108

217

DNA_pol_A_exo1

PF01612 DNA_pol_A_exo1 37-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057786485.1`	Pfam	`PF01612`	DNA_pol_A_exo1	Domain	37	209	1.3e-15	58.3	3'-5' exonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057930502.1
TACTACTATAATTTCTTCCTTCTCTTTCATTTCCAAAAACCGCTCCAATTAACACACACTCGCACACAGTAAGTTTCAACTCATTAACAATGGCGATCTCGATTCAGGACCACCGCGTACCGTCATCGGAGGGCTACAACACCTACGACGTCTACTTCTACGACGACTCCATCTCGACCACTGTCACCACCTCCCCGGATAAGGTATCCGAGTGGATCAACGAGGTTGAGTGGATCCACCGCCGCCGCCTCCACCGCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131003932
ATGGCGATCTCGATTCAGGACCACCGCGTACCGTCATCGGAGGGCTACAACACCTACGACGTCTACTTCTACGACGACTCCATCTCGACCACTGTCACCACCTCCCCGGATAAGGTATCCGAGTGGATCAACGAGGTTGAGTGGATCCACCGCCGCCGCCTCCACCGCCTCATCGTCGGCCTCGACGTTGAATGGCGCCCTTCTTCCGAACGCCGCCGCCGGAACCCCGTGGCCACGCTTCAGCTCTGCGTCGGCCGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057786485.1
MAISIQDHRVPSSEGYNTYDVYFYDDSISTTVTTSPDKVSEWINEVEWIHRRRLHRLIVGLDVEWRPSSERRRRNPVATLQLCVGRRCLVYQIYHSRYIPQTLADFLSEENYTFVGVGIQSDLGKLYNDYEIGGDAGYVDLRELAANEYGMNSLKNAGLKRLAVVVLETEFDKPRQVTMSRWDNRWLTAEQVQYATVDAFVSFEIGRALNACDYGLD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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