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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr01G004509

染色体: Chr01 坐标: 63179042-63182578 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr01G004509
名称SmilChr01G004509
描述probable WRKY transcription factor 41
染色体 / SeqIDChr01 / NC_080387.1
坐标与链方向63179042 - 63182578 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131003859
GeneID131003859
locus_tag-
NCBI NameLOC131003859
原始查询SmilChr01G004509

查看完整 ID 对照表

文献序列与新 ID 证据

这些记录来自论文中明确给出的 accession，并通过序列比对映射到当前参考版本。网站定位属于计算预测；论文中的实验定位和互作单独列出。

论文基因名Accession当前 ID比对置信度来源
SmWRKY61
CORE-036; 2021		 KM823184 LOC131003859
SmilChr01G004509
GeneID 131003859		 nucleotide CDS and protein BLAST against active nuclear reference, 2026-09-27; identity 99.801%; coverage 99.01% Exact or near-exact sequence match DOI

打开完整文献证据

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述probable WRKY transcription factor 41
产物probable WRKY transcription factor 41
ArabidopsisAT4G11070 (WRKY41)
WRKY family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826708]
identity=33.9; qcov=1.05; evalue=6.21e-24; confidence=low
RiceOs08g0386200 (OsWRKY69)
-
identity=46; qcov=0.546; evalue=9.7e-23; confidence=medium
GOGO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG-
PfamPF03106 (WRKY)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131003859

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057786395.1
2 Nucleoplasm 核质 1.00000 XP_057786422.1
3 Nuclear body 核内小体 0.20000 XP_057786422.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057786395.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057786395.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr1:63179734 A AG 1bp_insertion frameshift_variant 62 A10,A18,A21,A4,A8,B104,B105,B108,B110,B114,B121,B129,B13,B130,B133,B138,B140,B18,B31,B36,B37,B38,B39,B4,B46,B47,B5,B50,B51,B55,B56,B59,B70,B77,B8,B82,B87,B89,B9,B96,C10,C17,C2,C23,C3,C32,C35,C36,C39,C41,C42,C52,C54,C57,C68,C74,C8,C84,D1,D10,D2,D6
Chr1:63179758 AT A 1bp_deletion frameshift_variant 3 C2,C32,C68
Chr1:63179758 AT A 1bp_deletion CDS_variant 3 C2,C32,C68
Chr1:63179797 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B26
Chr1:63179812 CG C 1bp_deletion frameshift_variant 1 C76
Chr1:63179812 CG C 1bp_deletion CDS_variant 1 C76
Chr1:63179878 C CT 1bp_insertion frameshift_variant 1 B26
Chr1:63179878 C CT 1bp_insertion CDS_variant 1 B26
Chr1:63180000 A AAT 2bp_insertion frameshift_variant 14 B104,B114,B140,B38,B39,B4,B46,B51,B70,B99,C32,C39,C41,C68
Chr1:63180002 ACT A 2bp_deletion frameshift_variant 6 B104,B114,B140,B99,C39,C41
Chr1:63180007 A AC 1bp_insertion frameshift_variant 6 B104,B114,B140,B99,C39,C41
Chr1:63180037 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B117,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786395.1
257 aa
N
1
128
257
WRKY
C
PF03106 WRKY 109-166 aa
XP_057786401.1
257 aa
N
1
128
257
WRKY
C
PF03106 WRKY 109-166 aa
XP_057786410.1
257 aa
N
1
128
257
WRKY
C
PF03106 WRKY 109-166 aa
XP_057786422.1
201 aa
N
1
100
201
WRKY
C
PF03106 WRKY 109-166 aa
XP_057786429.1
201 aa
N
1
100
201
WRKY
C
PF03106 WRKY 109-166 aa
XP_057786435.1
201 aa
N
1
100
201
WRKY
C
PF03106 WRKY 109-166 aa
XP_057786439.1
183 aa
N
1
92
183
WRKY
C
PF03106 WRKY 109-166 aa
XP_057786444.1
183 aa
N
1
92
183
WRKY
C
PF03106 WRKY 109-166 aa
XP_057786447.1
183 aa
N
1
92
183
WRKY
C
PF03106 WRKY 109-166 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057786395.1 Pfam PF03106 WRKY Domain 109 166 3.5e-25 88.7 WRKY DNA -binding domain
XP_057786401.1 Pfam PF03106 WRKY Domain 109 166 3.5e-25 88.7 WRKY DNA -binding domain
XP_057786410.1 Pfam PF03106 WRKY Domain 109 166 3.5e-25 88.7 WRKY DNA -binding domain
XP_057786422.1 Pfam PF03106 WRKY Domain 109 166 2.3e-25 89.3 WRKY DNA -binding domain
XP_057786429.1 Pfam PF03106 WRKY Domain 109 166 2.3e-25 89.3 WRKY DNA -binding domain
XP_057786435.1 Pfam PF03106 WRKY Domain 109 166 2.3e-25 89.3 WRKY DNA -binding domain
XP_057786439.1 Pfam PF03106 WRKY Domain 109 166 1.9e-25 89.6 WRKY DNA -binding domain
XP_057786444.1 Pfam PF03106 WRKY Domain 109 166 1.9e-25 89.6 WRKY DNA -binding domain
XP_057786447.1 Pfam PF03106 WRKY Domain 109 166 1.9e-25 89.6 WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

10 records

下载 cDNA FASTA
XR_009094840.1
ATTAATTGGTGTTCCTCTTTTATTCACAAGAATTGAATTGACTTGAAGAAAAATATCTCATGGGCAAAATTATCTTCTCGATTCGTATGTTATAGTCTTCTCTATCAAAGCCCTCTCCTTGACTAGCAGTTTGCAGATAGTTCTCGTCAAGGCACGAGGATGGAAAGCGAGTATCTTGAGCTGTACAAATCAGTGGTTAGTGAGATCAGCAAAGGGATGGAGCAAGTGAAAGAGTGTTGTTCCAACAAGGAGCAAGATGG...
XM_057930439.1
AGATGGATTAATTGGTGTTCCTCTTTTATTCACAAGAATTGAATTGACTTGAAGAAAAATATCTCATGGGCAAAATTATCTTCTCGATTCGTATGTTATAGTCTTCTCTATCAAAGCCCTCTCCTTGACTAGCAGTTTGCAGATAGTTCTCGTCAAGGCACGAGGATGGAAAGCGAGTATCTTGAGCTGTACAAATCAGTGGTTAGTGAGATCAGCAAAGGGATGGAGCAAGTGAAAGAGTGTTGTTCCAACAAGGAGCA...

CDS

9 records

下载 CDS FASTA
LOC131003859
ATGGAAAGCGAGTATCTTGAGCTGTACAAATCAGTGGTTAGTGAGATCAGCAAAGGGATGGAGCAAGTGAAAGAGTGTTGTTCCAACAAGGAGCAAGATGGATTTTTGGAGAGAATGTTGTCTTCCCATGAAGAGGCTCTATTGATTCTTACGGGGCGTGCTCCACAGGGACAATGTCAGTCAGGGATATCATCGTTATCAGATCCTCCCGACTCTCCAACTGGATCCAAAGATGCAAGAAGCCGTTTGTGGAAAAGGGA...
LOC131003859
ATGGAAAGCGAGTATCTTGAGCTGTACAAATCAGTGGTTAGTGAGATCAGCAAAGGGATGGAGCAAGTGAAAGAGTGTTGTTCCAACAAGGAGCAAGATGGATTTTTGGAGAGAATGTTGTCTTCCCATGAAGAGGCTCTATTGATTCTTACGGGGCGTGCTCCACAGGGACAATGTCAGTCAGGGATATCATCGTTATCAGATCCTCCCGACTCTCCAACTGGATCCAAAGATGCAAGAAGCCGTTTGTGGAAAAGGGA...

Protein

9 records

下载 Protein FASTA
XP_057786395.1
MESEYLELYKSVVSEISKGMEQVKECCSNKEQDGFLERMLSSHEEALLILTGRAPQGQCQSGISSLSDPPDSPTGSKDARSRLWKREYFKRRNKIVKIEASSDSELPHEDGYAWRKYGKKAILNAKYPRGYYRCIQSKTCLAKKRVQRSDDGTVFEVTYKGQHTCPGRVLKKKKKFIEAEQEGYDGYGLDGTLTGGKVLEGSLLSRIFDCLLPLELLDEIKKTKYLLVMSLISLFFQILNSLECEWCEKFYFVIRID
XP_057786401.1
MESEYLELYKSVVSEISKGMEQVKECCSNKEQDGFLERMLSSHEEALLILTGRAPQGQCQSGISSLSDPPDSPTGSKDARSRLWKREYFKRRNKIVKIEASSDSELPHEDGYAWRKYGKKAILNAKYPRGYYRCIQSKTCLAKKRVQRSDDGTVFEVTYKGQHTCPGRVLKKKKKFIEAEQEGYDGYGLDGTLTGGKVLEGSLLSRIFDCLLPLELLDEIKKTKYLLVMSLISLFFQILNSLECEWCEKFYFVIRID

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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