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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004512`

染色体: Chr01 坐标: 63234750-63236316 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004512`
名称	SmilChr01G004512
描述	calmodulin-binding protein 25
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63234750 - 63236316 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003941`
GeneID	`131003941`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003941`
原始查询	`SmilChr01G004512`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calmodulin-binding protein 25
产物	calmodulin-binding protein 25
Arabidopsis	`AT3G56880` (AT3G56880) VQ motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824855] identity=38.4; qcov=1.13; evalue=3.26e-36; confidence=medium
Rice	`Os01g0278000` (OsVQ1) - identity=45.9; qcov=0.394; evalue=3.73e-12; confidence=low
GO	GO:0005516 (calmodulin binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006970 (response to osmotic stress)
KEGG	-
Pfam	PF05678 (VQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003941

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057786492.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057786492.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057786492.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057786492.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057786492.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63235321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:63235396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:63235423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr1:63235516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B6,B99,C31,C39
`Chr1:63235672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr1:63235694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr1:63235744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr1:63235804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B73
`Chr1:63235810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:63235864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786492.1

216 aa

108

216

PF05678 VQ 109-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057786492.1`	Pfam	`PF05678`	VQ	Motif	109	131	5.3e-10	39.3	VQ motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057930509.1
GATCGAAATTTGATAATGTCGGAACCAGACAAACCAAACACGGCGCTATTGAGCCGAGTAAGACGGAAGCCGATTAGAGCCGTCAAGCACTGCAGCTACCTAATTAGCTCAGTAAATTACAGTCTAATCACCACTACAAAAATATCCCTCTCTACTAAACCACGGTTTACTATCCGTACATCTCTAGCTGCCGCGTGTCCCGAGAAACGCGCTTCTTTCCTTCACCGCCCTATTTATTAACCCCTCTCCCCTCTCCTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131003941
ATGGCGTCTGATAATTTGATGGCGATGGAGCAGCCGTGGATGTTCCGCCCGACATTCGGCGACGCTTGGCTCGCCGATATCTTCACCAAGGAAACCGATACCCTAACAAAGGCTCTGCAGAAATCGATCTCGACGACGTCGTCCGACTGTGATGCTTTCTCCGCCGAAATGGTCGATTCGCTCTTTGCGAAGCCGGAGGCCCCGGCGCCGCTCCAGACGCCTACCGCCTCCGGAGGCTCCGAGAACTACGCGCCGGTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057786492.1
MASDNLMAMEQPWMFRPTFGDAWLADIFTKETDTLTKALQKSISTTSSDCDAFSAEMVDSLFAKPEAPAPLQTPTASGGSENYAPVSKQRRSVPPSGRVAKRKSRASKRATTTFITADPANFRQMVQQVTGVRFGGFSEQLPVLKPEPQRAFGRMQQGTALPTFDTSVRLLDGSAASLAAPPYMMSVGAGDGGTGAGGIDFDSFCSFPTLESSRVM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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