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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004533`

染色体: Chr01 坐标: 63495354-63500178 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004533`
名称	SmilChr01G004533
描述	probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD14
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63495354 - 63500178 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003218`
GeneID	`131003218`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003218`
原始查询	`SmilChr01G004533`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD14
产物	probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD14
Arabidopsis	`AT1G08680` (ZIGA4) ARF GAP-like zinc finger-containing protein ZIGA4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837390] identity=40.4; qcov=1.09; evalue=6.35e-142; confidence=medium
Rice	`Os01g0813900` - identity=58.8; qcov=0.509; evalue=1.82e-119; confidence=medium
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity)
KEGG	-
Pfam	PF01412 (ArfGap)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003218

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057785692.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057785687.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057785692.1`
4	Endosome	内体	0.20000	`XP_057785681.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057785692.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63495682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr1:63496079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B12
`Chr1:63496475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B12
`Chr1:63497262`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B132,B29,B49,B69,B7,D7
`Chr1:63497264`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B132,B29,B49,B69,B7,D7
`Chr1:63497267`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B132,B29,B49,B69,B7,D7
`Chr1:63497297`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B132,B29,B49,B7,D7
`Chr1:63497297`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B132,B29,B49,B7,D7
`Chr1:63497304`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B132,B29,B49,B7,D7
`Chr1:63497304`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B132,B29,B49,B7,D7
`Chr1:63497308`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B132,B29,B49,B7,D7
`Chr1:63497308`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B132,B29,B49,B7,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785681.1

683 aa

342

683

ArfGap

PF01412 ArfGap 12-123 aa

XP_057785687.1

653 aa

326

653

ArfGap

PF01412 ArfGap 12-123 aa

XP_057785692.1

645 aa

322

645

ArfGap

PF01412 ArfGap 12-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785681.1`	Pfam	`PF01412`	ArfGap	Domain	12	123	2.3e-29	102.6	Putative GTPase activating protein for Arf
`XP_057785687.1`	Pfam	`PF01412`	ArfGap	Domain	12	123	2.1e-29	102.7	Putative GTPase activating protein for Arf
`XP_057785692.1`	Pfam	`PF01412`	ArfGap	Domain	12	123	2.1e-29	102.7	Putative GTPase activating protein for Arf

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929698.1
TATACATCTGCCACTGCCAGCACTAATCCCCTCCCTCCAGACCGACGCACAACCCCTAAAGCATATCGTACTAGCCAAAAGAAGCGCAGCACGCCAGGATCTCTCCTGGCGTTAGGGTTTTTAAACGGCCAATAATTATTCAATCATCAACATCATTACCCAAAATTGAATTACCCGACATAGGAGAGAGAGTGAGATAGTAAAGAGAGAGAGCCATAGCTGATTCAAAGCTAGCTTCTGTCGATTCTATTTGAAAACAA...

XM_057929709.1
ATCTGCCACTGCCAGCACTAATCCCCTCCCTCCAGACCGACGCACAACCCCTAAAGCATATCGTACTAGCCAAAAGAAGCGCAGCACGCCAGGATCTCTCCTGGCGTTAGGGTTTTTAAACGGCCAATAATTATTCAATCATCAACATCATTACCCAAAATTGAATTACCCGACATAGGAGAGAGAGTGAGATAGTAAAGAGAGAGAGCCATAGCTGATTCAAAGCTAGCTTCTGTCGATTCTATTTGAAAACAAAAGGA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131003218
ATGGGTAGCAAAAGGGAAGAAGAGAGAAACGAGAAGATTATAAGGGGTCTCATGAAGCTTCCTCCTAATCGTCGATGCATTAACTGCAACAGCTTGGGTCCTCAATATGTATGCACAAACTTTTGGACGTTTATTTGTACTACATGTAGTGGAATACATCGTGAGTTCACACATCGTGTCAAGTCAGTTTCCATGGCCAAATTTACTTTTCAAGAAGTGGATGCTCTTCAGAAAGGAGGTAATCAGCGTGCGAGGGAGTT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057785681.1
MGSKREEERNEKIIRGLMKLPPNRRCINCNSLGPQYVCTNFWTFICTTCSGIHREFTHRVKSVSMAKFTFQEVDALQKGGNQRARELFLKAWDPERNRLVDNSNIDKLRDFIKNVYVDKKYSMEKSSDRPPRDPQSLRSQDDEMRRASSYHSYSQSPPYDFQYEERRYGKHAPSLTRKPGSDRGLYEGKLAGFLSPNRLSDYAKNDRFSKDGSYSRMSDYSGNRGIDLFISDVLSTSSQKETGSPFSEASRDISNEAPSL...

XP_057785687.1
MGSKREEERNEKIIRGLMKLPPNRRCINCNSLGPQYVCTNFWTFICTTCSGIHREFTHRVKSVSMAKFTFQEVDALQKGGNQRARELFLKAWDPERNRLVDNSNIDKLRDFIKNVYVDKKYSMEKSSDRPPRDPQSLRSQDDEMRRASSYHSYSQSPPYDFQYEERRYGKHAPSLTRKPGSDRGLYEGKLAGFLSPNRLSDYAKNDSSQKETGSPFSEASRDISNEAPSLHKSDAINSKFHPQPQRTASLGSFGSFDSSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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