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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004537`

染色体: Chr01 坐标: 63530726-63531610 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004537`
名称	SmilChr01G004537
描述	uncharacterized SmilChr01G004537
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63530726 - 63531610 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011382`
GeneID	`131011382`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011382`
原始查询	`SmilChr01G004537`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=36.6; qcov=0.66; evalue=1.19e-42; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011382

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795167.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057795167.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057795167.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795167.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795167.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63530737`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A13,B1,B102,B11,B129,B138,B2,B31,B35,B47,B56,B72,B8,B86,B96,C26,C38,C47,C75,C86,D1
`Chr1:63530760`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A11,B107,B127,B65,D4
`Chr1:63530760`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A11,B107,B127,B65,D4
`Chr1:63530800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:63530809`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B134,B37,C82,C83
`Chr1:63530809`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B134,B37,C82,C83
`Chr1:63530819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A18,A19,A24,A7,B108,B118,B12,B121,B126,B127,B2,B28,B30,B34,B40,B51,B59,B78,B86,C17,C24,C33,C42,C55,C63,C71,C73,C80,D8
`Chr1:63530827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr1:63530829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,C82,C83
`Chr1:63530841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,C82,C83
`Chr1:63530843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:63530911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B2,B25,B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795167.1

294 aa

147

294

DUF7769

PF24964 DUF7769 10-64 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795167.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	10	64	3.1e-11	43.5	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939184.1
ATGGCAGAAAATAGAGAGTCTTCAAAGTTAAATAATGATGAAAGAAATCAAGTTGCACAGTGGTTGTTGCAACGGAGTTCCAACGGCAAACTTCAATACGGCGCAAAGAAGGAGGCAGCCACACTCTTCAAACTTAGTTTGAAGACTATTTATCTCATTTGGAAATCGGCAACTGCCCAACAAGCGCTCGGACGACCTATACAATTGAAATCAATGAAAAGAGGTTCAACACACAAGGATAAATGGGCGATCGATTCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011382
ATGGCAGAAAATAGAGAGTCTTCAAAGTTAAATAATGATGAAAGAAATCAAGTTGCACAGTGGTTGTTGCAACGGAGTTCCAACGGCAAACTTCAATACGGCGCAAAGAAGGAGGCAGCCACACTCTTCAAACTTAGTTTGAAGACTATTTATCTCATTTGGAAATCGGCAACTGCCCAACAAGCGCTCGGACGACCTATACAATTGAAATCAATGAAAAGAGGTTCAACACACAAGGATAAATGGGCGATCGATTCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795167.1
MAENRESSKLNNDERNQVAQWLLQRSSNGKLQYGAKKEAATLFKLSLKTIYLIWKSATAQQALGRPIQLKSMKRGSTHKDKWAIDSEKVKKLSVLQRSSIRVMACNLGVSKSLVGVWVKDKKLRAHTNAIKPLLTPQNKISRLRWSLRQLSDINVEGFIKFQTMFNTIHIDEKWFYLTKSKDRYYLMPGELDPYRACKSNRYIPKIMFSCASARPIKAKGDNNYKIPHMNKERLERIGMLPDAISISQQLVDESMEFLEG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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