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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004551`

染色体: Chr01 坐标: 63623874-63626192 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004551`
名称	SmilChr01G004551
描述	14 kDa zinc-binding protein-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63623874 - 63626192 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004077`
GeneID	`131004077`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004077`
原始查询	`SmilChr01G004551`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	14 kDa zinc-binding protein-like
产物	14 kDa zinc-binding protein-like
Arabidopsis	`AT3G56490` (HIT3) HIS triad family protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824816] identity=77.8; qcov=0.954; evalue=2.72e-81; confidence=high
Rice	`Os03g0322500` - identity=80.6; qcov=0.854; evalue=7.6e-78; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006790 (sulfur compound metabolic process); GO:0009150 (purine ribonucleotide metabolic process); GO:0047627 (adenylylsulfatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01230 (HIT); PF11969 (DcpS_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004077

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057786659.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057786659.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057786659.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057786659.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057786659.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63624173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A21
`Chr1:63624173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr1:63624546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B20
`Chr1:63624571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B33,B42,D4
`Chr1:63624595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B32
`Chr1:63626005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786659.1

151 aa

151

DcpS_C

HIT

PF11969 DcpS_C 40-142 aa PF01230 HIT 48-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057786659.1`	Pfam	`PF11969`	DcpS_C	Family	40	142	1.7e-19	71.1	Scavenger mRNA decapping enzyme C-term binding
`XP_057786659.1`	Pfam	`PF01230`	HIT	Domain	48	145	5e-27	95.1	HIT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057930676.1
AAAAATTAACCCAATAACATTATTTTTGGTGATCAAAAGTTGGATTTGGACCCTTATTCTCCAAAACAAAAAAAAAAAGGAAGAATCTTGAATTTCAGTCCGAAAAATAAAAATGAAAACTAAAAAATAAAAGGGAAGCATGAGCTGAATGAGCAAACAAGAAAACCCCAGCTGCAGCCGACTGCTGCGCCTCACTTCTCATTTGCTTGCGCCCATGGCTTCCGAAAAGGAGGCTGCTCTTGCTGCTGCCCCCTCTGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131004077
ATGAGCAAACAAGAAAACCCCAGCTGCAGCCGACTGCTGCGCCTCACTTCTCATTTGCTTGCGCCCATGGCTTCCGAAAAGGAGGCTGCTCTTGCTGCTGCCCCCTCTGATTCTCCCACCATATTCGACAAGATCATCAACAAGCAAATACCGGCCAACGTCGTCTATGAGGATGAACAGGTTCTGGCTTTCAGGGACATAGCTCCCCAAGCGCCTATTCACATCCTCATTATCCCTAAAGTGAGGGATGGACTGATTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057786659.1
MSKQENPSCSRLLRLTSHLLAPMASEKEAALAAAPSDSPTIFDKIINKQIPANVVYEDEQVLAFRDIAPQAPIHILIIPKVRDGLIGISTAEERHCEILGRLLYTAKLVAKQEGLKDGFRIVINDGPNGCQSVYHLHVHLLGGRQMNWPPG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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