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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004555`

染色体: Chr01 坐标: 63646008-63646901 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004555`
名称	SmilChr01G004555
描述	uncharacterized SmilChr01G004555
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63646008 - 63646901 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011401`
GeneID	`131011401`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011401`
原始查询	`SmilChr01G004555`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0439900` - identity=29.8; qcov=0.882; evalue=6.57e-28; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011401

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795198.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057795198.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057795198.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795198.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795198.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63646046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B94,C15,C35
`Chr1:63646050`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C27,C73
`Chr1:63646050`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C27,C73
`Chr1:63646104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B54,B86
`Chr1:63646109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B13,B98
`Chr1:63646111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B65,B69,D9
`Chr1:63646112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B83,C74
`Chr1:63646135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C7
`Chr1:63646147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B57,C56
`Chr1:63646148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:63646157`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	101	A1,A2,A22,A3,A4,A5,A7,B100,B110,B113,B115,B117,B118,B122,B123,B128,B13,B130,B133,B134,B137,B14,B140,B15,B16,B20,B21,B22,B28,B3,B32,B34,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B46,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B61,B63,B66,B67,B77,B79,B82,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B94,B95,B97,B98,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C2,C21,C23,C25,C27,C28,C29,C33,C34,C35,C4,C44,C48,C49,C5,C55,C58,C6,C62,C65,C67,C68,C72,C78,C8,C80,C81,D11,D3,D4,D5
`Chr1:63646166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939215.1
ATGAACCTTGGCGATAAAGTTAGTTGGCCGGAGAAAATGAGAGCCCCACCCGACCAAAGAGATAGATCAAAATGGTGTGACTTCCACAGTGACCACGGTCACCGCACGGACGAATGCATCGCGCTCAGACTGGAAGTGGCGAACTTATTGAAAAAAGGGCACCTCACCAATTACTTGACTGACAAAGGCAAGCAGACCCTGCAGCAGGCGAGGGATAGACAAGAGAAACACAGAGATGACAGCCCGCCGGACCCGCCACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011401
ATGAACCTTGGCGATAAAGTTAGTTGGCCGGAGAAAATGAGAGCCCCACCCGACCAAAGAGATAGATCAAAATGGTGTGACTTCCACAGTGACCACGGTCACCGCACGGACGAATGCATCGCGCTCAGACTGGAAGTGGCGAACTTATTGAAAAAAGGGCACCTCACCAATTACTTGACTGACAAAGGCAAGCAGACCCTGCAGCAGGCGAGGGATAGACAAGAGAAACACAGAGATGACAGCCCGCCGGACCCGCCACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795198.1
MNLGDKVSWPEKMRAPPDQRDRSKWCDFHSDHGHRTDECIALRLEVANLLKKGHLTNYLTDKGKQTLQQARDRQEKHRDDSPPDPPHHERTVNVISGGSEVSGITHSAAKRHTRQARSSKSGVPPSGRTGTTDPTQLISFATSESDKLLHPHHDALVISIYIANCLTKRALIDNGSSANILFYSAYREMGLDESKLIKKAAVLVGFSGESTTTVGEIDLPVYAEGVNLSTRFLVVDAPSAYSVILGRPWIHGMEAVPSTY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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