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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004559`

染色体: Chr01 坐标: 63672047-63676805 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004559`
名称	SmilChr01G004559
描述	seven transmembrane protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63672047 - 63676805 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004137`
GeneID	`131004137`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004137`
原始查询	`SmilChr01G004559`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	seven transmembrane protein 1-like
产物	seven transmembrane protein 1-like
Arabidopsis	`AT2G41050` (AT2G41050) PQ-loop repeat family protein / transmembrane family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818704] identity=51.4; qcov=0.929; evalue=1.26e-116; confidence=high
Rice	`Os01g0266800` - identity=48.5; qcov=1.03; evalue=3.13e-117; confidence=high
GO	-
KEGG	smil04148 (Efferocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04193 (PQ-loop)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004137

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057786733.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057786733.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057786733.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057786733.1`
5	Endosome membrane	内体膜	0.20000	`XP_057786733.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63672840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B118,B90,D2
`Chr1:63673064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B139,B98
`Chr1:63673450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:63676223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:63676244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786733.1

396 aa

198

396

PQ-loop

PF04193 PQ-loop 33-88 aa PF04193 PQ-loop 295-353 aa

XP_057786739.1

396 aa

198

396

PQ-loop

PF04193 PQ-loop 33-88 aa PF04193 PQ-loop 295-353 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057786733.1`	Pfam	`PF04193`	PQ-loop	Repeat	33	88	2e-40	137.1	PQ loop repeat
`XP_057786733.1`	Pfam	`PF04193`	PQ-loop	Repeat	295	353	2e-40	137.1	PQ loop repeat
`XP_057786739.1`	Pfam	`PF04193`	PQ-loop	Repeat	33	88	2e-40	137.1	PQ loop repeat
`XP_057786739.1`	Pfam	`PF04193`	PQ-loop	Repeat	295	353	2e-40	137.1	PQ loop repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057930750.1
TATATTGGAGAGAATGAAAGGAGACGAGCAGAAAAGAAAGAAAAAAAGGAAAAAAAGGAGAGGGGCTTAAGTGAGAATTAAACAAAGTAGTGGGCGGAAAACGAAAATCTGGAAAAGCGGTGCAGTCCCACTGTAGTTGTGCCACCTTGACGTATCCATTGAGGATTCACGTTGGAAATCTTCATGTCCTTTCACAATTAAACCTAATATTCATACAGATCGTCACCGCCTGGGGCTGATGAAGGGGGAACCAGTGATGT...

XM_057930756.1
CTACAAATCCACCACGTTAACCTACATTCTCTGTTTAAATTATTGTCACTCAATACACAGATCGAAGCCAAACATTCCTTTTTTTTTGTTTTTGTTTGTGTTTTCCCCCTTTTTGCACTCCGTCAATTTGAATTTCACGCACCTGGACATCTCATTGGGGCTGATGAAGGGGGAACCAGTGATGTGCCCTGTTGATCAGCATTGCCTCCAATGGGCTCGGCGGTATATCGGGTCGTGCCTCTGCAGCACGCGGCACGGGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131004137
ATGAAGGGGGAACCAGTGATGTGCCCTGTTGATCAGCATTGCCTCCAATGGGCTCGGCGGTATATCGGGTCGTGCCTCTGCAGCACGCGGCACGGGTTCTCAGTGGGTCTGGGGGTTGTTAGTGTCGTGAGCTGGTGTGTGGCTGAGATACCACAGATCATCACCAACTACAGAAAGAAATCTGCTGAGGGACTCTCTATTCTGTTTCTTATGACATGGATTGTTGGAGATTTTTTCAACCTTTTTGGCTGCATGCTAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057786733.1
MKGEPVMCPVDQHCLQWARRYIGSCLCSTRHGFSVGLGVVSVVSWCVAEIPQIITNYRKKSAEGLSILFLMTWIVGDFFNLFGCMLEPETLPTQYYTAVLYAVTTVILSLQAVYYDHIYPRLKSNKRRQEAVQAEAAERRERNNDSDTEKGSYGQRCGVPPSSTIHVVSSSPSSYDELYFMSARSLSVSRTPPAGSFLGPRSPLLDIEQRWFREPLLGEGRSPKSGTPKIKAMLCVVSLMTFLVGSHNHLQAERLENNSA...

XP_057786739.1
MKGEPVMCPVDQHCLQWARRYIGSCLCSTRHGFSVGLGVVSVVSWCVAEIPQIITNYRKKSAEGLSILFLMTWIVGDFFNLFGCMLEPETLPTQYYTAVLYAVTTVILSLQAVYYDHIYPRLKSNKRRQEAVQAEAAERRERNNDSDTEKGSYGQRCGVPPSSTIHVVSSSPSSYDELYFMSARSLSVSRTPPAGSFLGPRSPLLDIEQRWFREPLLGEGRSPKSGTPKIKAMLCVVSLMTFLVGSHNHLQAERLENNSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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