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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004567`

染色体: Chr01 坐标: 63733651-63736157 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004567`
名称	SmilChr01G004567
描述	protein PNS1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63733651 - 63736157 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004269`
GeneID	`131004269`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004269`
原始查询	`SmilChr01G004567`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PNS1-like
产物	protein PNS1-like
Arabidopsis	`AT3G04440` (AT3G04440) Plasma-membrane choline transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819599] identity=49.6; qcov=0.983; evalue=3.4e-145; confidence=high
Rice	`Os07g0656100` - identity=33.7; qcov=0.99; evalue=1.31e-76; confidence=low
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF04515 (Choline_transpo)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004269

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057786903.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057786903.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057786903.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057786903.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057786903.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63735388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B16
`Chr1:63735392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:63735520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C17
`Chr1:63735820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr1:63735856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B98,C27,C48,C52,C87
`Chr1:63735865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C38
`Chr1:63735893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B85,C15,C72,C82,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786903.1

416 aa

208

416

Choline_transpo

PF04515 Choline_transpo 111-395 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057786903.1`	Pfam	`PF04515`	Choline_transpo	Family	111	395	1e-23	84.8	Plasma-membrane choline transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057930920.1
TAGCTTGCTACAGTAGAACGCTATAAACACACGACACTACGGCTAATATCGATCACTTATCACATATGCATAAAGTAGAATGAAGAATGATAAATAAAATTATTTGCGAGTTTTATTATTCTTTTCTCTATTTTCTAAGTGATCCCGTTACCTGAGCTACATCTAACTATAAATCGAACATCTTCCTAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAAATAAGAAGACCATATATAAATCCAAAATACGAATTTCATTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131004269
ATGAGGAGGGAGGGGAACTTCCTCGGCAAGCTTTTCCGGCACCTTTTCTACATTCACTTGCTTCTAATCACTATCCTAGTGATATTCCTCACGGTGTGTGGCGTGCTAACAGCTGCCCGCAACCGTCATTTCCATCCTGAGAAGTGGTACATACTAGTCCTCTCTTCAACAGCTTGCGCCGGAGTCTTAGGATTCTCATGGCAAGCATTGACAGGTTTCAACCCTTCAAGAACTCTCAAGGCTACATTCTGGCTAAGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057786903.1
MRREGNFLGKLFRHLFYIHLLLITILVIFLTVCGVLTAARNRHFHPEKWYILVLSSTACAGVLGFSWQALTGFNPSRTLKATFWLSPLLTCSFGILLVSIGTPGSLAASVIALIFSILQSLYACWVNPRFEHSSRILKASIAYNPLKVKTSVVLSIIASTLYSCILMAGIGGAAATRTMVDTLFIILILGSLTWTTQIIKNMMQVTVAHIKYMQFTCGIEVDFKAVVKTAAKYSMGNICFGSILIPVLTVIRGSARAVSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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