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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004581`

染色体: Chr01 坐标: 63852750-63856419 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004581`
名称	SmilChr01G004581
描述	F-box protein SKIP24
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63852750 - 63856419 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004515`
GeneID	`131004515`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004515`
原始查询	`SmilChr01G004581`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein SKIP24
产物	F-box protein SKIP24
Arabidopsis	`AT1G08710` (AT1G08710) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837392] identity=44.2; qcov=0.677; evalue=6.94e-67; confidence=medium
Rice	`Os01g0814700` (OsFbox047) - identity=37.4; qcov=0.538; evalue=1.42e-32; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF12937 (F-box-like); PF28649 (SKIP24_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004515

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057787203.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057787203.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057787203.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787203.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787203.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63853417`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B133,B32,B53,B71,B77,B92,C66,C78
`Chr1:63853426`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B133,B53,C66
`Chr1:63853426`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B133,B53,C66
`Chr1:63853484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:63853496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:63853597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:63854988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B56,B96,D2
`Chr1:63855070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:63855083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:63855604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A24,B13,B39,B81
`Chr1:63855645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B40,C2,C42,C72
`Chr1:63855657`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A2,A24,C49,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787203.1

368 aa

184

368

F-box-like

SKIP24_C

PF12937 F-box-like 2-52 aa PF28649 SKIP24_C 111-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787203.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	2	52	2.3e-08	34.4	F-box-like
`XP_057787203.1`	Pfam	`PF28649`	SKIP24_C	Domain	111	223	1.8e-42	144.6	SKIP24 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931220.1
TTTTGAGAGTTGACGGCCCACTTGTTCTTATTAGGGCTGATCCACTCGTGAACGGCCCAATCGAGCAATCATGATTCATGATCATTAATCATATGTCTGAAGCTAAGCGAGTGACCGGTGAGGTGACGAAGGGAATTCTGGAGCTACAACAAAAATGTCGGTGCTACCGGACGAGCTGTGGAGAAGCATAATGGAGATTGGTATTCAAACCAAAACTCTAGATTACAAGAATCTGTGCTGCCTCTCCATCACCTGCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131004515
ATGTCGGTGCTACCGGACGAGCTGTGGAGAAGCATAATGGAGATTGGTATTCAAACCAAAACTCTAGATTACAAGAATCTGTGCTGCCTCTCCATCACCTGCCGCCGGCTTCGGCGACTCGCCGCCGAAGATTCTCTCTGGTCGCATCTTCTTCTTTCCGATTTCCCTTCTACGAAAAACAATTCAAATTCGGGCGACGGTGATAGGAAAATCGGTACCCGAGATAACAGTTACACCTCGTCTTCAAATTCCAGCAGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787203.1
MSVLPDELWRSIMEIGIQTKTLDYKNLCCLSITCRRLRRLAAEDSLWSHLLLSDFPSTKNNSNSGDGDRKIGTRDNSYTSSSNSSSMAKYLYQIRYEKDREKKRLAHRRAILRIESEIAERLRKIGEIKLQSLEEKKKMSKAVAELFNLRRIRQASVAVNVWQPEIIRSRQREMVQQTNVPVDVRINALEMELSLCKQQIAAFDNAIRVEKKRCRAAEEELASVKYHPLHDLENTRGHSSGCGVRSTRLKHTSMVPECFI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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