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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004585`

染色体: Chr01 坐标: 63881075-63883595 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004585`
名称	SmilChr01G004585
描述	glutaredoxin-C4
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63881075 - 63883595 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004723`
GeneID	`131004723`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004723`
原始查询	`SmilChr01G004585`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutaredoxin-C4
产物	glutaredoxin-C4
Arabidopsis	`AT5G20500` (AT5G20500) Glutaredoxin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832172] identity=62.8; qcov=0.932; evalue=3.6e-59; confidence=high
Rice	`Os02g0646400` (OsGRX10) - identity=57.5; qcov=0.721; evalue=2.06e-42; confidence=medium
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0015038 (glutathione disulfide oxidoreductase activity); GO:0034599 (cellular response to oxidative stress)
KEGG	-
Pfam	PF00462 (Glutaredoxin); PF13409 (GST_N_2); PF13417 (GST_N_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004723

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057787446.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057787446.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057787460.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787446.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787446.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63882491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr1:63882495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:63882844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B100,B102,B57,B77,C28,C31,C54
`Chr1:63882977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C36
`Chr1:63883021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787446.1

149 aa

149

Glutaredoxin

GST_N_3

PF00462 Glutaredoxin 56-117 aa PF13417 GST_N_3 61-122 aa

XP_057787460.1

147 aa

147

Glutaredoxin

GST_N_3

GST_N_2

PF00462 Glutaredoxin 56-117 aa PF13417 GST_N_3 61-124 aa PF13409 GST_N_2 63-129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787446.1`	Pfam	`PF00462`	Glutaredoxin	Domain	56	117	6e-20	71.9	Glutaredoxin
`XP_057787446.1`	Pfam	`PF13417`	GST_N_3	Domain	61	122	7.9e-06	26.8	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057787460.1`	Pfam	`PF00462`	Glutaredoxin	Domain	56	117	5.6e-20	72.0	Glutaredoxin
`XP_057787460.1`	Pfam	`PF13417`	GST_N_3	Domain	61	124	1.6e-06	29.1	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057787460.1`	Pfam	`PF13409`	GST_N_2	Domain	63	129	5.7e-06	27.6	Glutathione S-transferase, N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095096.1
AGAGGGGGGAGGGAAGAGGAGAGAGAGAGCCCAAAATCAAACGAAAAGGGGTTTTGCAAAGATCCAGAAATTTAATCGTTGCTCTGATAAGTAAAGATCCGATCTTGGGTAGGTCAGGCGATATAACTCTGATTGCATAGAAATATGGCGACGCCTTCTGCAGCATCAGGAAATGTACAATCGCTGCTGCAATACGTCTCGGTGATAACATTAATGGCTTCCATTTTGACGGCGTCATACTTCACCAGCGTGGAAGCAAA...

XR_009095095.1
AGAGGGGGGAGGGAAGAGGAGAGAGAGAGCCCAAAATCAAACGAAAAGGGGTTTTGCAAAGATCCAGAAATTTAATCGTTGCTCTGATAAGTAAAGATCCGATCTTGGGTAGGTCAGGCGATATAACTCTGATTGCATAGAAATATGGCGACGCCTTCTGCAGCATCAGGAAATGTACAATCGCTGCTGCAATACGTCTCGGTGATAACATTAATGGCTTCCATTTTGACGGCGTCATACTTCACCAGCGTGGAAGCAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131004723
ATGGCGACGCCTTCTGCAGCATCAGGAAATGTACAATCGCTGCTGCAATACGTCTCGGTGATAACATTAATGGCTTCCATTTTGACGGCGTCATACTTCACCAGCGTGGAAGCAAAGCCCAAATCATCAACTGCTTTTGTGAAGAAGACCGTTTCCTCTCATTCCATAGTTATCTTCTCCAAATCTTACTGCCCATATTGTAGAAGGGCTAAAGCAGTCTTCAAGGAGCTGAAGCAGGAGCCATATGTTGTTGAACTTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057787446.1
MATPSAASGNVQSLLQYVSVITLMASILTASYFTSVEAKPKSSTAFVKKTVSSHSIVIFSKSYCPYCRRAKAVFKELKQEPYVVELDERDDGGKIQDALSKIVGRRTVPQVFINGKHLGGSDGNLFLFRVQFLPHGARLTAASSVTKNM

XP_057787460.1
MATPSAASGNVQSLLQYVSVITLMASILTASYFTSVEAKPKSSTAFVKKTVSSHSIVIFSKSYCPYCRRAKAVFKELKQEPYVVELDERDDGGKIQDALSKIVGRRTVPQVFINGKHLGGSDDTVEAYENGELAKLLGIGSVDEEEL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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