当前解析结果
SmilChr01G004592| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004592 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004592 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004592 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 63921435 - 63922453 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131004749 |
|---|---|
| GeneID | 131004749 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131004749 |
| 原始查询 | SmilChr01G004592 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF27922 (CLE_plant) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131004749 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057787485.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057787485.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057787485.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057787485.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057787485.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:63921912 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 30 | A15,A16,A21,A5,B109,B113,B121,B126,B127,B130,B136,B138,B18,B30,B33,B45,B6,B62,B72,B79,B80,C17,C20,C25,C30,C35,C56,C75,C78,D4 |
Chr1:63922083 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B114,C38,C75 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057787485.1PF27922
CLE_plant 64-135 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057787485.1 |
Pfam | PF27922 |
CLE_plant | Family | 64 | 135 | 2.5e-09 | 39.2 | CLAVATA3/ESR (CLE)-related protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。