当前解析结果
SmilChr01G004600| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004600 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004600 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004600 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 63989068 - 63990373 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131004685 |
|---|---|
| GeneID | 131004685 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131004685 |
| 原始查询 | SmilChr01G004600 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835840]; symbol=AT5G57345; hit=AT5G57345; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835840]; symbol=AT5G57345; hit=AT5G57345; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G57345 (AT5G57345)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835840] identity=59.3; qcov=1.01; evalue=2.65e-49; confidence=medium |
| Rice | Os06g0694800- identity=63.6; qcov=0.807; evalue=4.33e-42; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131004685 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057787382.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057787382.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 1.00000 | XP_057787382.1 |
| 4 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.20000 | XP_057787382.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057787382.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:63989259 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:63989385 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:63989430 |
TGG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 65 | A1,A14,A20,A6,B11,B112,B113,B115,B120,B121,B122,B123,B133,B137,B138,B139,B14,B19,B2,B21,B23,B26,B28,B30,B53,B55,B58,B64,B65,B68,B69,B70,B71,B74,B77,B81,B85,B98,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C21,C24,C26,C29,C32,C37,C4,C40,C42,C60,C61,C63,C65,C67,C68,C7,C70,C71,D10,D4 |
Chr1:63989433 |
C |
CCA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 65 | A1,A14,A20,A6,B11,B112,B113,B115,B120,B121,B122,B123,B133,B137,B138,B139,B14,B19,B2,B21,B23,B26,B28,B30,B53,B55,B58,B64,B65,B68,B69,B70,B71,B74,B77,B81,B85,B98,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C21,C24,C26,C29,C32,C37,C4,C40,C42,C60,C61,C63,C65,C67,C68,C7,C70,C71,D10,D4 |
Chr1:63989883 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。