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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004606`

染色体: Chr01 坐标: 64036168-64040572 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004606`
名称	SmilChr01G004606
描述	uncharacterized SmilChr01G004606
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64036168 - 64040572 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011429`
GeneID	`131011429`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011429`
原始查询	`SmilChr01G004606`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=24.4; qcov=0.913; evalue=1.1e-56; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=26.6; qcov=0.634; evalue=2.11e-52; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011429

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795220.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795220.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795220.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795220.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795220.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64036433`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A13,A15,A21,A23,A4,A5,B10,B124,B126,B129,B132,B50,B52,B66,B73,B88,B89,C10,C3,C33,C38,C45,C58,C61,C78,C83,C84,C87,D1
`Chr1:64037939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C54,D1
`Chr1:64037968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B43,C70,C87
`Chr1:64037978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D6
`Chr1:64037978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:64038017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C14,C58
`Chr1:64038063`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D1
`Chr1:64038063`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D1
`Chr1:64038088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B43,C42
`Chr1:64038104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr1:64038110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B35,C42
`Chr1:64038129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795220.1

895 aa

448

895

Transposase_mut

MULE

SWIM

PF00872 Transposase_mut 470-570 aa PF10551 MULE 471-565 aa PF04434 SWIM 714-744 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795220.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	470	570	8.2e-11	42.1	Transposase, Mutator family
`XP_057795220.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	471	565	5.9e-19	69.0	MULE transposase domain
`XP_057795220.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	714	744	3.8e-07	30.2	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939237.1
ATGATCAGTGGTATTCAAAATATCGAAATAGATGATGATGTACTGTTCATGGTTAATGAAAGGTCCAGTGTGTCCTCTGAGGAAAGGAAGCATGTGGATGGGGCAGGCCAGCTGAGGTTTAATGAAGCTATGTCGTTTCAAGCAATCGTTATACGACACAGTGGTCAGTGGAAATTAACCGAGTATGAAGGTGGCGATGAGGTTGTCGTGTACATGTCTAAGGAAGACCTTTGTCATGCGAAGTTGATGCAAGAGGTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011429
ATGATCAGTGGTATTCAAAATATCGAAATAGATGATGATGTACTGTTCATGGTTAATGAAAGGTCCAGTGTGTCCTCTGAGGAAAGGAAGCATGTGGATGGGGCAGGCCAGCTGAGGTTTAATGAAGCTATGTCGTTTCAAGCAATCGTTATACGACACAGTGGTCAGTGGAAATTAACCGAGTATGAAGGTGGCGATGAGGTTGTCGTGTACATGTCTAAGGAAGACCTTTGTCATGCGAAGTTGATGCAAGAGGTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795220.1
MISGIQNIEIDDDVLFMVNERSSVSSEERKHVDGAGQLRFNEAMSFQAIVIRHSGQWKLTEYEGGDEVVVYMSKEDLCHAKLMQEVHDQLNEDGRSTYMLFYTSTTDEGRKIKVALKTDSDLNRLISEHKKYLVVYVIEKGKQSAAPVPQTQERVYYEGHRSTVFPIETDIGRSIPTHDDSRDDSSSQEEEDESESSDEEEEAIRRREILDSVSTEQEAWRQTGPQNFTSDDQPDVEPFVGVQQLEARDWGIPVLDFDDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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