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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004607`

染色体: Chr01 坐标: 64046881-64049414 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004607`
名称	SmilChr01G004607
描述	uncharacterized SmilChr01G004607
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64046881 - 64049414 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004665`
GeneID	`131004665`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004665`
原始查询	`SmilChr01G004607`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835843]; symbol=AT5G57370; hit=AT5G57370; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835843]; symbol=AT5G57370; hit=AT5G57370; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G57370` (AT5G57370) U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835843] identity=56.5; qcov=0.633; evalue=4.94e-35; confidence=medium
Rice	`Os02g0461600` - identity=61.5; qcov=0.464; evalue=3.19e-28; confidence=medium
GO	GO:0008380 (RNA splicing); GO:0071011 (precatalytic spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF08648 (SNRNP27)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004665

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057787361.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	0.80000	`XP_057787361.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057787361.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787361.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787361.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64047140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:64047460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787361.1

196 aa

196

SNRNP27

PF08648 SNRNP27 137-192 aa

XP_057787365.1

196 aa

196

SNRNP27

PF08648 SNRNP27 137-192 aa

XP_057787371.1

196 aa

196

SNRNP27

PF08648 SNRNP27 137-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787361.1`	Pfam	`PF08648`	SNRNP27	Family	137	192	1e-23	83.8	U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoproteins
`XP_057787365.1`	Pfam	`PF08648`	SNRNP27	Family	137	192	1e-23	83.8	U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoproteins
`XP_057787371.1`	Pfam	`PF08648`	SNRNP27	Family	137	192	1e-23	83.8	U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoproteins

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931378.1
ATTTTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTGACTTGGGGAGGTTCTATATTTTTGCTTAAAAAAATTGTACATTTTTCACATAATAATCTTTTAATTTCACCAATCAATTTTCACATATTTCCAAATATTATCGAAAAAGGCCAAAAAAGGAAAGCACTGGTTGAGCTCAATAAGAAGCTGCAAAACCCAAAACCTTTCGAAATCCCAAATTCTCAGCCGTCTGCCATGAGCGACCGCCGCGACCGGGACAGGGACAGAGACCGAG...

XM_057931388.1
AAGGCCAAAAAAGGAAAGCACTGGTTGAGCTCAATAAGAAGCTGCAAAACCCAAAACCTTTCGAAATCCCAAATTCTCAGCCGTCTGCCATGAGCGACCGCCGCGACCGGGACAGGGACAGAGACCGAGATCGTGACCGGAAAAGAATCCGCGACGACCGCGATCTCGACCGTGACCGTGAGCGCGAGCGCGACAGAGACCGGGACCGTGATCGTAGCAGACGCTCTCACTCTCGCACGCCCGACCGCACTAGATCCCGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131004665
ATGAGCGACCGCCGCGACCGGGACAGGGACAGAGACCGAGATCGTGACCGGAAAAGAATCCGCGACGACCGCGATCTCGACCGTGACCGTGAGCGCGAGCGCGACAGAGACCGGGACCGTGATCGTAGCAGACGCTCTCACTCTCGCACGCCCGACCGCACTAGATCCCGGCACACACGGTCCCGAACTCGTTCCCCCGATGAGAGGGACCGCCACCGCCACCGTCACCGCCACCACCGGTCCCGCTCCCGCTCCCCTAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057787361.1
MSDRRDRDRDRDRDRDRKRIRDDRDLDRDRERERDRDRDRDRSRRSHSRTPDRTRSRHTRSRTRSPDERDRHRHRHRHHRSRSRSPTSPPRKRLKDEVVLKDKDKHKDDAVSKDKKQKENAAAGGDDGNKDEDFMDEDEMEMMKKFGIPAGFDSTKGKPVAGNDVGAVRKVTKRQPRQYMNRRGGFNRPLPPERNR

XP_057787365.1
MSDRRDRDRDRDRDRDRKRIRDDRDLDRDRERERDRDRDRDRSRRSHSRTPDRTRSRHTRSRTRSPDERDRHRHRHRHHRSRSRSPTSPPRKRLKDEVVLKDKDKHKDDAVSKDKKQKENAAAGGDDGNKDEDFMDEDEMEMMKKFGIPAGFDSTKGKPVAGNDVGAVRKVTKRQPRQYMNRRGGFNRPLPPERNR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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