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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004610`

染色体: Chr01 坐标: 64067743-64070632 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004610`
名称	SmilChr01G004610
描述	replication protein A 32 kDa subunit A
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64067743 - 64070632 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004596`
GeneID	`131004596`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004596`
原始查询	`SmilChr01G004610`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	replication protein A 32 kDa subunit A
产物	replication protein A 32 kDa subunit A
Arabidopsis	`AT2G24490` (RPA2) replicon protein A2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816985] identity=45.7; qcov=1.04; evalue=1.2e-76; confidence=high
Rice	`Os02g0633400` (RPA2B) - identity=38; qcov=0.921; evalue=1.93e-58; confidence=medium
GO	GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination); GO:0000781 (chromosome, telomeric region); GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005662 (DNA replication factor A complex); GO:0006260 (DNA replication); GO:0006289 (nucleotide-excision repair); GO:0035861 (site of double-strand break)
KEGG	smil03030 (DNA replication - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03430 (Mismatch repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03440 (Homologous recombination - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03460 (Fanconi anemia pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01336 (tRNA_anti-codon); PF08784 (RPA_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004596

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057787288.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787288.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787288.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057787288.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057787288.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64070500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787288.1

266 aa

133

266

tRNA_anti-codon

RPA_C

PF01336 tRNA_anti-codon 66-139 aa PF08784 RPA_C 160-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787288.1`	Pfam	`PF01336`	tRNA_anti-codon	Domain	66	139	1.8e-08	34.9	OB-fold nucleic acid binding domain
`XP_057787288.1`	Pfam	`PF08784`	RPA_C	Domain	160	258	3.1e-16	60.7	Replication protein A C terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931305.1
TCTACACTCTCTAAAACTTCCAACACATTTGAAACACAGAAACATCGGCGGAGGCGCAAAGCTTAGAGCGAGAAAATGATGTTCGAGAGCAGCCAATTCGACTCGACCCCCAGCTTCGTCTCTTCGCAAACCGCCGATCCATCTCCCTCCGCTGCCAAGATTCGAGATGCCCAGCCGATGCATCCGGTTACAGTGAAGCAAATAGTGGGAGCGAGTTCGTCGGACGACGACAAGTCGAATTTCCTCATCGACGGCATTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131004596
ATGATGTTCGAGAGCAGCCAATTCGACTCGACCCCCAGCTTCGTCTCTTCGCAAACCGCCGATCCATCTCCCTCCGCTGCCAAGATTCGAGATGCCCAGCCGATGCATCCGGTTACAGTGAAGCAAATAGTGGGAGCGAGTTCGTCGGACGACGACAAGTCGAATTTCCTCATCGACGGCATTAGCGTCTACAACGTGAAATTGGTTGGAATGGTATTCGACAAAACAACAAGAGTTACTGATGTATCGTTCGTGATTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787288.1
MMFESSQFDSTPSFVSSQTADPSPSAAKIRDAQPMHPVTVKQIVGASSSDDDKSNFLIDGISVYNVKLVGMVFDKTTRVTDVSFVIDDGTGRIGCTRWVNDAQDTQELEELTDGIYVRVHGYLKSFKGKRQIVVYAIRPVKDYNEIANHFIECAHAHSSNTRLQKNGSATLASSAATTPSNGQQAVSSSQVSQEYNLDGMGIIDKMVLDYLHLPTSIKQEQGISQNEIAQKLKISQEKIAEAMRSLEAQGEVYSTIDEFH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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