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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004612`

染色体: Chr01 坐标: 64076344-64081009 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004612`
名称	SmilChr01G004612
描述	gibberellin 2-beta-dioxygenase 6
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64076344 - 64081009 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004532`
GeneID	`131004532`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004532`
原始查询	`SmilChr01G004612`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	gibberellin 2-beta-dioxygenase 6
产物	gibberellin 2-beta-dioxygenase 6
Arabidopsis	`AT5G58660` (AT5G58660) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835980] identity=48.3; qcov=1.07; evalue=2.04e-85; confidence=high
Rice	`Os04g0407800` (OsGA2ox11) - identity=40.1; qcov=1.05; evalue=6.07e-58; confidence=medium
GO	GO:0051213 (dioxygenase activity)
KEGG	smil00904 (Diterpenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004532

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057787224.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057787224.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787224.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787224.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787224.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64076613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:64076696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:64076721`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B9
`Chr1:64076721`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B9
`Chr1:64076778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C43,C74,D8
`Chr1:64076947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A24,C49,C85
`Chr1:64077070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787224.1

330 aa

165

330

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 37-133 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 194-289 aa

XP_057787233.1

272 aa

136

272

2OG-FeII_Oxy

PF03171 2OG-FeII_Oxy 136-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787224.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	37	133	2.2e-11	45.1	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057787224.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	194	289	1.7e-28	99.6	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily
`XP_057787233.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	136	231	1.2e-28	100.1	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931250.1
AGATTAATGAAAATATCTACATTTATATATATGCTTGTCTTCTCTCAAAACAAGCAACCGGCGGCTTATAAAATACTGTTTAATAATTTGTTGGATGCAGTCGATGCGAGCTTGTGCTTGAATGTCTCCAAAAATATTTCATCATCTGGCCCCAGCCCCAGGCTGTGGAATTCGATTCCGATCCCCGCCCCAAATCCTGCTCTCTTCCCATCATAGATTTTGAGGCCTTGGAGGCGGCGCACCTGAGTCAGGTATGCCGG...

XM_057931241.1
TGATACTTGATGCTATAAAGCACGATCGATTGCAACAACACCATCCCCAAAACAGCAAAAGGGAAAAAGAAAATAAAAATAGTGATATTATAAATAGCGGCAACTTCGATAGCATGCACCTATTCCCACATTTCCTAATTCCTAGTACCAAGCCAAAACTATGTAAACAAAGGTGAGTAAAATAGTCATAAAAAAAGAATGAGCTCTTCACACAATTTCTCATCCTACCCTCCCTTCTTCCGCCCAAACCAGCCCCAGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131004532
ATGAGCTCTTCACACAATTTCTCATCCTACCCTCCCTTCTTCCGCCCAAACCAGCCCCAGCCCCAGGCTGTGGAATTCGATTCCGATCCCCGCCCCAAATCCTGCTCTCTTCCCATCATAGATTTTGAGGCCTTGGAGGCGGCGCACCTGAGTCAGGTATGCCGGGAATGGGGCATGTTCAGGTTGACCAACCACGGCGTCTCGTCGGAGCTGCTCACTCAGCTCCACAATCATGCCAACAAGCTCTTCTCCCACAAGTT...

LOC131004532
ATGTTCAGGTTGACCAACCACGGCGTCTCGTCGGAGCTGCTCACTCAGCTCCACAATCATGCCAACAAGCTCTTCTCCCACAAGTTTGAATGGAAAAAGGGCATTCCCACCACTCCTATGCTCTACTTTTGGGGCAACCCTGCTCTCACCATGTCTGGAAATGCTCAACAAAAAGGCCCTCCTCCTGCAGACCGCCACAACTGGTTGGAAGGTTTCAATGTTTCACTCACCAACATTTCTCACTTCCATTATCAAGATCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057787224.1
MSSSHNFSSYPPFFRPNQPQPQAVEFDSDPRPKSCSLPIIDFEALEAAHLSQVCREWGMFRLTNHGVSSELLTQLHNHANKLFSHKFEWKKGIPTTPMLYFWGNPALTMSGNAQQKGPPPADRHNWLEGFNVSLTNISHFHYQDPLLESFRCLLEEYGAHQTRLAKAIFKGMAENLDFPPPKSTSYLSPATGIIRVYRYLRCPAAERRWGIHEHTDSSVLSIIHQDQVGGLQVFKNNQWLDVEPIHDTLIVNLGDMMQAM...

XP_057787233.1
MFRLTNHGVSSELLTQLHNHANKLFSHKFEWKKGIPTTPMLYFWGNPALTMSGNAQQKGPPPADRHNWLEGFNVSLTNISHFHYQDPLLESFRCLLEEYGAHQTRLAKAIFKGMAENLDFPPPKSTSYLSPATGIIRVYRYLRCPAAERRWGIHEHTDSSVLSIIHQDQVGGLQVFKNNQWLDVEPIHDTLIVNLGDMMQAMSDDEYVSVTHRVKVNRVKERVSIGYFVFPAEDGVIHTSNYKPFTYADFQAKNELDLKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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