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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004618`

染色体: Chr01 坐标: 64202602-64204477 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004618`
名称	SmilChr01G004618
描述	AAA-ATPase At5g57480-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64202602 - 64204477 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004803`
GeneID	`131004803`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004803`
原始查询	`SmilChr01G004618`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AAA-ATPase At5g57480-like
产物	AAA-ATPase At5g57480-like
Arabidopsis	`AT5G57480` (AT5G57480) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835852] identity=72.6; qcov=0.969; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0431100` - identity=42.7; qcov=0.896; evalue=1.32e-121; confidence=medium
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA); PF14363 (AAA_assoc); PF25568 (AAA_lid_At3g28540)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004803

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057787548.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057787548.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057787548.1`
4	Peroxisome membrane	过氧化物酶体膜	0.20000	`XP_057787548.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787548.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64202731`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	50	A11,A15,A20,A5,A8,A9,B1,B10,B101,B108,B110,B117,B118,B119,B2,B20,B22,B4,B40,B41,B46,B52,B53,B55,B56,B66,B81,B82,B83,B84,B86,B90,B91,B92,B94,B96,C16,C17,C23,C4,C42,C45,C46,C48,C5,C52,C57,C58,D1,D6
`Chr1:64202733`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	51	A11,A15,A20,A5,A8,A9,B1,B10,B101,B108,B110,B117,B118,B119,B2,B20,B22,B4,B40,B41,B46,B52,B53,B55,B56,B66,B81,B82,B83,B84,B86,B90,B91,B92,B94,B96,C16,C17,C23,C33,C4,C42,C45,C46,C48,C5,C52,C57,C58,D1,D6
`Chr1:64203000`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C70
`Chr1:64203000`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C70
`Chr1:64203003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr1:64203964`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C70
`Chr1:64203964`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C70
`Chr1:64204020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr1:64204031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787548.1

512 aa

256

512

AAA_assoc

AAA

AAA_lid_At3g28540

PF14363 AAA_assoc 26-118 aa PF00004 AAA 240-382 aa PF25568 AAA_lid_At3g28540 384-455 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787548.1`	Pfam	`PF14363`	AAA_assoc	Family	26	118	1.3e-22	80.8	Domain associated at C-terminal with AAA
`XP_057787548.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	240	382	9.3e-19	68.9	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057787548.1`	Pfam	`PF25568`	AAA_lid_At3g28540	Domain	384	455	8.9e-10	39.1	At3g28540-like, AAA+ ATPase lid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931565.1
TCTGATTAGTCTATATAATGTGTGTGTGTGTATATATCTGGGCAGCCCCCCACCCCCGCCCCGTGATAATATAAATCTCCCTCCAAGCAAGATTCTTTTCCTTATATTAGAGGAAGATTAGATTAAAAGATTTGAATAATCCATGAGTTTGGTCTATAAATCCATGAGAATTTGATAATATGCATATGCATACACCCTATTCCTCTCTCTAACATCGAATCTGCAGGGTAGAAAATGAAAGAGATGTGGACAACCATGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131004803
ATGAAAGAGATGTGGACAACCATGGCATCCATAATGGGGGTGTGGGCCTTCGGGCAGAGCCTCCTCCACACGGTGTTCCCGCCGGAGCTCCGGTTCGCGTCCGTGAAGCTCTTCCACCGCCTCTTCAGCTACTTCTCCTCCTACTGCTACTACGACATCACCGAGATCGACGGCGTCAACACCAACGAGCTCTACAACGCCGTCCAGCTCTACCTGAGCTCCTCGGCGTCCATCGCGGGCACCCGCCTGAGCCTGACGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787548.1
MKEMWTTMASIMGVWAFGQSLLHTVFPPELRFASVKLFHRLFSYFSSYCYYDITEIDGVNTNELYNAVQLYLSSSASIAGTRLSLTRGLNSSSITFGLSNNDRLIDSFKGATVEWEHVVTQRQSQTFSWRPLPEEKRGFTLRVRKKNKHLVLNSYLDFVMDKANELRRKNQDRLLYTNSRGGSLDSRGHPWESVPFKHPSTFDTLAMDPAKKAEIMADLLDFANGEAFYQKTGRAWKRGYLLYGPPGTGKSSMIAAMANF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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