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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004623`

染色体: Chr01 坐标: 64255501-64262368 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004623`
名称	SmilChr01G004623
描述	4-coumarate--CoA ligase CCL1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64255501 - 64262368 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004816`
GeneID	`131004816`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004816`
原始查询	`SmilChr01G004623`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	4-coumarate--CoA ligase CCL1-like
产物	4-coumarate--CoA ligase CCL1-like
Arabidopsis	`AT3G21240` (4CL2) 4-coumarate:CoA ligase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821678] identity=61.7; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0177600` (4CL3) - identity=59; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016405 (CoA-ligase activity)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00501 (AMP-binding); PF13193 (AMP-binding_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004816

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057787558.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057787558.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057787558.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787558.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787558.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64256063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C59
`Chr1:64256078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B55,B90,B92
`Chr1:64256089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,C15,C21
`Chr1:64256188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:64256235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:64256237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr1:64256271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B65
`Chr1:64256497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:64260025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B136,B16,C11,C69
`Chr1:64260028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:64260035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B50
`Chr1:64260048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787558.1

535 aa

268

535

AMP-binding

AMP-binding_C

PF00501 AMP-binding 34-399 aa PF13193 AMP-binding_C 450-525 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787558.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	34	399	1.7e-94	317.5	AMP-binding enzyme
`XP_057787558.1`	Pfam	`PF13193`	AMP-binding_C	Domain	450	525	8.1e-18	65.8	AMP-binding enzyme C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931575.1
TCTCATCTCACATTAGATGGACCTTGAAGTATATCTACTAATAAATCCCACATAAATAAAAAGTCTCCGCTGAGTAGCAGACAAATTAGAGCTAAGAGTAATGAGCCTAAGAGTAATCTATACTTTACAATAAATGAAAGGGAAGGATGTAAATAGTACATATTCAAGGTCGCTTTAAATTGTGATACAATCTCATGTCCCAAAAAAGTCACCGAAATCACACCTCAGCAATAATAAACATTACTTCTTGTTTGTTTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131004816
ATGGAGTTGAAACAGGAAAACGAACACATCTTCCGTTCAAAGCTTCCAGACATCAATATACCCACCCATCTCCCTCTACACACATATTGCTTCCAAAACCTCTCCACCCACCGGGCCCGCCCCTATCTAATCAACGCCGCCACCGGCGATACCTTCACCCATGCCGGATTCGAGCTCACCGCGCGCAGAGTCGCCGCCGGCCTCCACAACCTCGGCATCCGAAAATCGGACGTCGTCATGCTTCTCCTCCACAACTCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787558.1
MELKQENEHIFRSKLPDINIPTHLPLHTYCFQNLSTHRARPYLINAATGDTFTHAGFELTARRVAAGLHNLGIRKSDVVMLLLHNSPEFAFAFLGASFIGAISTTANPLYTASEIALQARISRPKLIVTHACHVEKVKHYAAEAGAKIATIDPPPSPEIIHFAELRRSDEKLLTPVEIHADDTVALPFSSGTTGLPKGVMLSHKNLVACVSQQVDGENPAVHIDREDRMLCVLPLFHVYSMISVMLCCLRVGAAVVIMPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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