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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004631`

染色体: Chr01 坐标: 64349703-64351884 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004631`
名称	SmilChr01G004631
描述	60S ribosomal protein L10
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64349703 - 64351884 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004916`
GeneID	`131004916`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004916`
原始查询	`SmilChr01G004631`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L10
产物	60S ribosomal protein L10
Arabidopsis	`AT1G26910` (RPL10B) Ribosomal protein L16p/L10e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837036] identity=86.4; qcov=0.995; evalue=2.36e-143; confidence=high
Rice	`Os05g0169100` (SG12) - identity=87.2; qcov=0.991; evalue=2.48e-143; confidence=high
GO	GO:0000027 (ribosomal large subunit assembly); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00252 (Ribosomal_L16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004916

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057787666.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057787666.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057787666.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787666.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787666.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64349936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:64350520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B20,B86,C44
`Chr1:64350533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C40
`Chr1:64350558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr1:64350573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	A15,A16,A18,A20,A7,B102,B124,B129,B136,B20,B3,B39,B42,B45,B5,B57,B59,B62,B65,B71,B73,B75,B78,B84,C21,C22,C24,C31,C35,C40,C45,C54,C56,C60,C70,C74,C75,C77,C80,C84,D1,D2
`Chr1:64350575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B5,B78,C75,C77
`Chr1:64350601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B33
`Chr1:64350651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A19,B121,B55,B61,C42,C71
`Chr1:64350784`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B10,B42,B43
`Chr1:64350784`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B10,B42,B43
`Chr1:64350812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B24,B55,C20,C64
`Chr1:64350857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B40,B44,B76,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787666.1

221 aa

110

221

Ribosomal_L16

PF00252 Ribosomal_L16 12-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787666.1`	Pfam	`PF00252`	Ribosomal_L16	Domain	12	166	4.8e-36	124.3	Ribosomal protein L16p/L10e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931683.1
GAAGCTTTAAAAGTCATTTTACTTCCACTTAGGCGAACCGGAACACGGGCCGATATTGGGCCCAAATTCGTAGCTACTAAAGGGGCTTGATTGCAACCATAAAATCACTAAAAAATTAGGGTTAGGGTTTCTGCATTTGTCTTGAATCGGGGAGCCGAGCAGACTCATCGCCATGGGGAGAAGACCTGCAAGGTGCTATCGTCAAATCAAGAACAAACCCTACCCAAAGTCACGATTCTGTCGTGGTGTGCCTGATCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131004916
ATGGGGAGAAGACCTGCAAGGTGCTATCGTCAAATCAAGAACAAACCCTACCCAAAGTCACGATTCTGTCGTGGTGTGCCTGATCCCAAGATCAGGATTTATGATGTGGGAATGAAAAGAAAGGGTGTTGATGAATTTCCTTTCTGTGTGCATTTGGTCAGTTGGGAGAAGGAAAATGTTTCAAGTGAGGCACTTGAAGCAGCACGTATTGCATGCAACAAGTACATGACAAAGTTTGCTGGAAAGGATGCTTTCCATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787666.1
MGRRPARCYRQIKNKPYPKSRFCRGVPDPKIRIYDVGMKRKGVDEFPFCVHLVSWEKENVSSEALEAARIACNKYMTKFAGKDAFHLRVRVHPFHVLRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGVCARVAIGQVLLSVRCKDSNSPHAQEALRRAKFKFPGRQKIIVSRKWGFTKYNRTDYLRWKSENRIMPDGVNAKLLGCHGPLALRQPGRAFVDAATL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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