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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004643`

染色体: Chr01 坐标: 64464478-64469989 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004643`
名称	SmilChr01G004643
描述	ADP-ribosylation factor 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64464478 - 64469989 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004995`
GeneID	`131004995`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004995`
原始查询	`SmilChr01G004643`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ADP-ribosylation factor 1-like
产物	ADP-ribosylation factor 1-like
Arabidopsis	`AT2G24765` (ARF3) ADP-ribosylation factor 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817014] identity=92.2; qcov=0.989; evalue=1.07e-126; confidence=high
Rice	`Os08g0248900` (OsARF3) - identity=92.9; qcov=1; evalue=4e-127; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	-
Pfam	PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF01926 (MMR_HSR1); PF04670 (Gtr1_RagA); PF08477 (Roc); PF09439 (SRPRB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004995

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057787755.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057787755.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057787755.1`
4	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057787755.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057787755.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64466908`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C73
`Chr1:64466908`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C73
`Chr1:64469247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787755.1

182 aa

182

Arf

SRPRB

MMR_HSR1

Gtr1_RagA

Roc

Ras

PF00025 Arf 6-176 aa PF09439 SRPRB 16-153 aa PF01926 MMR_HSR1 19-124 aa PF04670 Gtr1_RagA 19-129 aa PF08477 Roc 19-129 aa PF00071 Ras 19-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787755.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	6	176	3.4e-78	261.8	ADP-ribosylation factor family
`XP_057787755.1`	Pfam	`PF09439`	SRPRB	Domain	16	153	2.6e-12	47.2	Signal recognition particle receptor beta subunit
`XP_057787755.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	19	124	2.4e-05	25.1	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057787755.1`	Pfam	`PF04670`	Gtr1_RagA	Domain	19	129	2.1e-08	34.6	Gtr1/RagA G protein conserved region
`XP_057787755.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	19	129	8.6e-14	52.5	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057787755.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	19	171	2.7e-11	44.0	Ras family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931772.1
AGAAAACAACAATCAACGCAAAAAAGAAAAAGAAAAGAAAAGCCACGTTTACTTATGTAGAAACCAAGTTTGGTCCCATGTGTCCCGAATCTCTGTTAAAATAGCAAATTCGCCACCATTACTTCTGATATTCACAATTCAACCCACCCAAATCGCATTCATTCTCTCCGGTAGATCCTCCCATTTGCGTCCTCCTCTACTGCAAACTTTAGCTACGCTACGTAATAGTGGCTACAATTTCATTGTTGCGAAACTCCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131004995
ATGGGAATTGTTTTTACGCGGTTGTTTTCGTCGCTGTTTGGGAATAAGGAAGCTCGGATCCTTGTCCTGGGGCTCGACAATGCGGGAAAAACTACCATTCTTTATCGGCTTCAGATGGGCGAAGTTGTCTCCACTATTCCAACAATTGGGTTCAATGTGGAAACCGTTCAATATAACAACATAAAGTTTCAAGTTTGGGACCTAGGTGGACAAACTAGTATCAGGCCATACTGGAGGTGTTATTTTCCTAACACGCAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787755.1
MGIVFTRLFSSLFGNKEARILVLGLDNAGKTTILYRLQMGEVVSTIPTIGFNVETVQYNNIKFQVWDLGGQTSIRPYWRCYFPNTQAIIYVVDSSDTDRLMIAKEEFHAILEEEELKGSVVLLFANKQDLPGALDDAAITEALELHKIKNRQWAIFKTSAIKGEGLFEGLDWLSNTLKSGGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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