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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004650`

染色体: Chr01 坐标: 64579846-64585707 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004650`
名称	SmilChr01G004650
描述	glutamate receptor 2.8-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64579846 - 64585707 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005000`
GeneID	`131005000`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005000`
原始查询	`SmilChr01G004650`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamate receptor 2.8-like
产物	glutamate receptor 2.8-like
Arabidopsis	`AT2G29110` (GLR2.8) glutamate receptor 2.8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817459] identity=37.5; qcov=0.93; evalue=1.02e-178; confidence=medium
Rice	`Os09g0429200` (OsGLR2.2) - identity=36.8; qcov=0.904; evalue=1.33e-175; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006811 (monoatomic ion transport); GO:0015276 (ligand-gated monoatomic ion channel activity); GO:0038023 (signaling receptor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00060 (Lig_chan); PF00497 (SBP_bac_3); PF01094 (ANF_receptor); PF13458 (Peripla_BP_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005000

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057787760.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787760.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787760.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787760.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057787760.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64582841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:64582893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:64583100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr1:64583281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B55,C85
`Chr1:64583473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr1:64583781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr1:64584174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr1:64584269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr1:64584377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:64584719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B107
`Chr1:64584743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B18,B30,D5
`Chr1:64584878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B29,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787760.1

944 aa

472

944

Peripla_BP_6

ANF_receptor

SBP_bac_3

Lig_chan

PF13458 Peripla_BP_6 51-360 aa PF01094 ANF_receptor 68-414 aa PF00497 SBP_bac_3 498-814 aa PF00060 Lig_chan 593-847 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787760.1`	Pfam	`PF13458`	Peripla_BP_6	Family	51	360	5.8e-10	40.1	Periplasmic binding protein
`XP_057787760.1`	Pfam	`PF01094`	ANF_receptor	Domain	68	414	4.9e-66	223.9	Receptor family ligand binding region
`XP_057787760.1`	Pfam	`PF00497`	SBP_bac_3	Domain	498	814	6.8e-08	33.1	Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
`XP_057787760.1`	Pfam	`PF00060`	Lig_chan	Family	593	847	3.9e-18	66.4	Ligand-gated ion channel

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931777.1
TCCATCACATCTTTTCTCTATTTATAAAATCTCAAGTAGGTGACATTACGATGGAAAGAAAACCAATGGCCATGATAATTAACAATATTATTCATCGCTGTCATCTCTTCAGAATCAATATTCTGATATTTTTCTTGCTGTTTGATAGCTACGCCTCTGCTGCAAAAAACAAAACTTCGGAAGGCTCACAGCCTTCGGCCATCCCCATTGGCGTAGTTCTTGACGTGAACTCGCCGATGGGATTCATGGCGGATTCGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005000
ATGGAAAGAAAACCAATGGCCATGATAATTAACAATATTATTCATCGCTGTCATCTCTTCAGAATCAATATTCTGATATTTTTCTTGCTGTTTGATAGCTACGCCTCTGCTGCAAAAAACAAAACTTCGGAAGGCTCACAGCCTTCGGCCATCCCCATTGGCGTAGTTCTTGACGTGAACTCGCCGATGGGATTCATGGCGGATTCGTGCATGAAAATGGCGGTAGCGGATTTTTACGAAAACCATCCAAATTATGCTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787760.1
MERKPMAMIINNIIHRCHLFRINILIFFLLFDSYASAAKNKTSEGSQPSAIPIGVVLDVNSPMGFMADSCMKMAVADFYENHPNYATRLQLHTRNAESILDANFAVVELLKQEVVQGVIGPQRSTEDTFFAELGQNVRVPIISFASSSSATSYTDNHYFIRATPDDAVQMQALAAICKGFQWSELAILYEDTDSGSHFVSLLNKEFQKADIGLSYMVAIPNSADDKDILKELNKLATRQTRVFLVHMNLALGNRLFPLAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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